当前解析结果
SmilChr01G002100| 统一新 Gene ID | SmilChr01G002100 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G002100 |
| 描述 | wound-induced basic protein |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 37033679 - 37034870 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131023380 |
|---|---|
| GeneID | 131023380 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131023380 |
| 原始查询 | SmilChr01G002100 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | wound-induced basic protein |
| 产物 | wound-induced basic protein |
| Arabidopsis | AT3G07230 (AT3G07230)wound-responsive protein-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819912] identity=74.5; qcov=1; evalue=3.96e-19; confidence=low |
| Rice | Os12g0405700- identity=89.6; qcov=1.02; evalue=8.4e-25; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF08186 (Wound_ind) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131023380 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057808903.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.40000 | XP_057808903.1 |
| 3 | Secreted | 分泌到胞外 | 0.20000 | XP_057808903.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057808903.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057808903.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057808903.1PF08186
Wound_ind 1-47 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057808903.1 |
Pfam | PF08186 |
Wound_ind | Family | 1 | 47 | 1.5e-21 | 77.2 | Wound-inducible basic protein family |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。