当前解析结果
SmilChr01G002101| 统一新 Gene ID | SmilChr01G002101 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G002101 |
| 描述 | ethylene-responsive transcription factor-like protein At4g13040 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 37049818 - 37054190 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131023385 |
|---|---|
| GeneID | 131023385 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131023385 |
| 原始查询 | SmilChr01G002101 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | ethylene-responsive transcription factor-like protein At4g13040 |
| 产物 | ethylene-responsive transcription factor-like protein At4g13040 |
| Arabidopsis | AT4G13040 (AT4G13040)Integrase-type DNA-binding superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826918] identity=76.1; qcov=0.42; evalue=9.11e-47; confidence=low |
| Rice | Os02g0499000 (OsERF#140)- identity=58.9; qcov=0.9; evalue=5.24e-49; confidence=medium |
| GO | GO:0003677 (DNA binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131023385 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057808910.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057808910.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057808910.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057808910.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057808910.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:37051620 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B126,B55,B91,C2,C57 |
Chr1:37053069 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A20,B18,B28,C74 |
Chr1:37053639 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A2,C39 |
Chr1:37053766 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B139 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
3 records
下载 cDNA FASTA3 records
下载 CDS FASTA3 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。