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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002103`

染色体: Chr01 坐标: 37061424-37062479 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002103`
名称	SmilChr01G002103
描述	uncharacterized SmilChr01G002103
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	37061424 - 37062479 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023408`
GeneID	`131023408`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023408`
原始查询	`SmilChr01G002103`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF09331 (DUF1985); PF29561 (DUF8566)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023408

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808933.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057808933.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057808933.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808933.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808933.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:37061534`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,B22,C3,C48
`Chr1:37061554`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B110
`Chr1:37061575`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B56,C21,C55
`Chr1:37061576`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B69,B78,B79
`Chr1:37061596`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A16,B140,B88,C62,C66
`Chr1:37061607`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B103,B109,B125,C41,D10
`Chr1:37061611`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B50,B68
`Chr1:37061625`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	A5,B12,B4,B55,B88,B98
`Chr1:37061652`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B28,B86,C13,C59
`Chr1:37061655`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B117,B122,C2
`Chr1:37061658`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,A24,A7,B11,B96
`Chr1:37061667`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	11	A10,A20,B105,B122,B131,B43,B78,B91,B97,C28,C68

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808933.1

274 aa

137

274

DUF1985

DUF8566

PF09331 DUF1985 3-125 aa PF29561 DUF8566 3-146 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808933.1`	Pfam	`PF09331`	DUF1985	Family	3	125	6.1e-10	39.9	Domain of unknown function (DUF1985)
`XP_057808933.1`	Pfam	`PF29561`	DUF8566	Domain	3	146	1.4e-07	32.3	Domain of unknown function (DUF8566)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952950.1
TTTAGAGCATCATGTTTTGGGCATTTCACTGATTGGAGGCCCGGCCCGAAGAGCAATAAAGCCTTACACCAGATTGTATCGAGGCAGATTGTGTCAGAAGACGATGAGATGTGCTTCTTTCTGTGCGGAGCACGAGTCAGATTTTCCCCAGCGGACTACGCATTAGTGACTGGGCTCAATTTCGGGGGATCGAGGTTCGATGCGACATTACAGCACGACTGCAGTCGCGTGGAGGCATACCGACGATTCTGCGGTGGGCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023408
ATGTGCTTCTTTCTGTGCGGAGCACGAGTCAGATTTTCCCCAGCGGACTACGCATTAGTGACTGGGCTCAATTTCGGGGGATCGAGGTTCGATGCGACATTACAGCACGACTGCAGTCGCGTGGAGGCATACCGACGATTCTGCGGTGGGCGAAGCATGACCATACAGTCGCTCATCAAACGCGTGTGCGATTTGGATCGTCGAGTGGATGATGAGGATGTGAGCCTGTACCTTCGTGCTGTCCTCGTGTGTGTGGCTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808933.1
MCFFLCGARVRFSPADYALVTGLNFGGSRFDATLQHDCSRVEAYRRFCGGRSMTIQSLIKRVCDLDRRVDDEDVSLYLRAVLVCVAHTLVLGLDARVQPWLWVLVDDLAAFDRFPWGAYSYKMLCHYTRETGKGEKYHFYGPSWALYVWALERVPGLGHMVAASSGDPTAHPRFLRWTFRGKPRLHGLRELFEGQGGVLPVEPDGDDLSSHYFITALTPGELSVSFRPPDNPLARGVQFPQHTGARFVEEREEDVPRQPR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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