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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002116`

染色体: Chr01 坐标: 37188261-37189920 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002116`
名称	SmilChr01G002116
描述	uncharacterized SmilChr01G002116
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	37188261 - 37189920 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023531`
GeneID	`131023531`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023531`
原始查询	`SmilChr01G002116`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	amino acid-ligase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819901]; symbol=AT3G07150; hit=AT3G07150; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	amino acid-ligase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819901]; symbol=AT3G07150; hit=AT3G07150; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G07150` (AT3G07150) amino acid-ligase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819901] identity=35.1; qcov=1.12; evalue=6.86e-30; confidence=medium
Rice	`Os01g0918400` - identity=53.1; qcov=0.346; evalue=2.42e-18; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF31065 (DUF8798)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023531

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057809061.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809061.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809061.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057809061.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057809061.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:37188491`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B111,B77,C25,C34,D8
`Chr1:37188725`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr1:37189412`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B53,B64,B83,C50,C75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809061.1

186 aa

186

DUF8798

PF31065 DUF8798 7-96 aa

XP_057809067.1

185 aa

185

DUF8798

PF31065 DUF8798 7-96 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809061.1`	Pfam	`PF31065`	DUF8798	Domain	7	96	2.4e-38	131.0	Domain of unknown function (DUF8798)
`XP_057809067.1`	Pfam	`PF31065`	DUF8798	Domain	7	96	2.4e-38	131.0	Domain of unknown function (DUF8798)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953078.1
GTTTTATTAAGATTAAAGTAGTCAGAAAAATTCTCAAAAAAAAAAAAAGTAGTCTGAAAAAACTCTTTTATAGACAGTTCGAGAATCAATTGGAAGTTGTAAGCCAGAGTAGCTCTTACTAAAGCAAAAAAAACTCTCACAAAAATCCAGAAACCAAACTGAAATTCGTGGCGTTTCTCTCAGTAGAAGTCGAAGATGGAAAGAGGAGAGATGATGATAGAGGTGGTGTGCCCGTCCCTATCCAAAGCAATCCAAATAGT...

XM_057953084.1
TTTTATTAAGATTAAAGTAGTCAGAAAAATTCTCAAAAAAAAAAAAAGTAGTCTGAAAAAACTCTTTTATAGACAGTTCGAGAATCAATTGGAAGTTGTAAGCCAGAGTAGCTCTTACTAAAGCAAAAAAAACTCTCACAAAAATCCAGAAACCAAACTGAAATTCGTGGCGTTTCTCTCAGTAGAAGTCGAAGATGGAAAGAGGAGAGATGATGATAGAGGTGGTGTGCCCGTCCCTATCCAAAGCAATCCAAATAGTT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131023531
ATGGAAAGAGGAGAGATGATGATAGAGGTGGTGTGCCCGTCCCTATCCAAAGCAATCCAAATAGTTGCAGTAGATGACCAGAAAGTAGACCTCGGCTCCATAGCCCGGCCATTAGGGCTCGACCCGAATACCCTCAAGCTCAACGGCTACTTCATCGCTAGAGGGCCCCATCACATCGCTTCTTCCCTCACCTGGAAATCTATTATTGCCTTCTTCTCCGCCCGTCGCCTGCCCACCGGCGCCGCCGCTTCCGCCGCTCT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057809061.1
MERGEMMIEVVCPSLSKAIQIVAVDDQKVDLGSIARPLGLDPNTLKLNGYFIARGPHHIASSLTWKSIIAFFSARRLPTGAAASAALLVDGKIASKRSHDVANVTGEIGCFRDSKRPQHDHCSRIPVGLHKASWLCLKRKCWLEDEGRVKRARLDEGRFSCSIISKNLKRMRIDEIVAAMPLKKLR

XP_057809067.1
MERGEMMIEVVCPSLSKAIQIVAVDDQKVDLGSIARPLGLDPNTLKLNGYFIARGPHHIASSLTWKSIIAFFSARRLPTGAAASAALLVDGKIASKRSHDVANVTGEIGCFRDSKRPQHDHCSRIPGLHKASWLCLKRKCWLEDEGRVKRARLDEGRFSCSIISKNLKRMRIDEIVAAMPLKKLR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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