当前解析结果
SmilChr01G002131| 统一新 Gene ID | SmilChr01G002131 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G002131 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G002131 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 37306206 - 37310302 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131007596 |
|---|---|
| GeneID | 131007596 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131007596 |
| 原始查询 | SmilChr01G002131 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131007596 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057790487.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057790487.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057790487.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057790487.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057790487.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:37306525 |
ATG |
A |
2bp_deletion | frameshift_variant | 40 | A8,B103,B112,B113,B125,B126,B130,B15,B3,B32,B41,B42,B43,B44,B50,B53,B62,B66,B70,B73,B76,B85,B86,B87,B88,B94,C14,C15,C16,C17,C26,C35,C41,C44,C46,C6,C63,C67,C83,C87 |
Chr1:37306570 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 15 | A18,A2,B106,B114,B17,B32,B62,C18,C23,C30,C38,C39,C47,C75,C76 |
Chr1:37306575 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B129,B139 |
Chr1:37306602 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr1:37306731 |
TA |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 2 | A22,B67 |
Chr1:37306731 |
TA |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 2 | A22,B67 |
Chr1:37306753 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A23,A5,B58 |
Chr1:37306760 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A23,A5,B58 |
Chr1:37306769 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B139 |
Chr1:37306804 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A2,B114,C39,C47 |
Chr1:37306814 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B94,C12,D3 |
Chr1:37306840 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B94,C12,D3 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。