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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002132`

染色体: Chr01 坐标: 37313759-37315634 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002132`
名称	SmilChr01G002132
描述	trihelix transcription factor ASIL2
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	37313759 - 37315634 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023679`
GeneID	`131023679`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023679`
原始查询	`SmilChr01G002132`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	trihelix transcription factor ASIL2
产物	trihelix transcription factor ASIL2
Arabidopsis	`AT3G24860` (AT3G24860) Homeodomain-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822084] identity=31.2; qcov=0.859; evalue=1.74e-29; confidence=low
Rice	`Os08g0484700` - identity=54.5; qcov=0.258; evalue=2.75e-24; confidence=weak
GO	GO:0000976 (transcription cis-regulatory region binding); GO:0005634 (nucleus)
KEGG	-
Pfam	PF10545 (MADF_DNA_bdg); PF13837 (Myb_DNA-bind_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023679

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057809219.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809219.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809219.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057809219.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057809219.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:37314137`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D11
`Chr1:37314137`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:37314142`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	A21,B115,B124,B20,C2,C65,C71
`Chr1:37314164`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B138
`Chr1:37314164`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B138
`Chr1:37314196`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	A23,B44
`Chr1:37314196`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	2	A23,B44
`Chr1:37314200`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	10	B109,B123,B22,B37,B47,B59,B63,B86,C47,D10
`Chr1:37314292`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C1,C17,C4,C49
`Chr1:37314367`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B27,C13,C78
`Chr1:37314386`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,B35
`Chr1:37314424`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,B39

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809219.1

384 aa

192

384

Myb_DNA-bind_4

MADF_DNA_bdg

PF13837 Myb_DNA-bind_4 58-142 aa PF10545 MADF_DNA_bdg 76-140 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809219.1`	Pfam	`PF13837`	Myb_DNA-bind_4	Domain	58	142	6e-16	59.3	Myb/SANT-like DNA-binding domain
`XP_057809219.1`	Pfam	`PF10545`	MADF_DNA_bdg	Domain	76	140	0.00012	23.0	Alcohol dehydrogenase transcription factor Myb/SANT-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953236.1
ATATATAATTATTCTGAACAAGGTATATTATATTAAAATCTTACTAAACAAACTCAAAAAATTGTTTTGAGCCAATATATCAAATTCGGCTCCACAAGCAAAAAAGCACGAGATTAAATACGAAAGTGAAAACTGCAGCACTTGAGGAAATCAGAACCGGAGGCAATGTGGTCCCCACACCTCAACCCATCCACCACTCCGCCGCCCTTTAGACCTCCCGCAACCCCCACACCCCCACATCTAACTCCACCCCACCGCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023679
ATGACTTCCTCCGCCTCCTCCCCCTCTCCCTCCGCCTCCCCGCCGCCCCGGCCTTTACTCCTGCCGACGTCGCGGCAATCTCACTCCGCCTCCCCATCCCCCTCGCCCAAACACCACCTCCCCCCGCCGGAATCCAAATCCTCCCCGCCCAAAAGGTCGCCGCCCCTGCCATGGACACACCAGGAAACCCTAGCCCTAATTCAGGCCTACCAGGAGAAATGGCACTCCCTCAAAAAAGGCCAGCTCAAAGCCTTCCAGTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809219.1
MTSSASSPSPSASPPPRPLLLPTSRQSHSASPSPSPKHHLPPPESKSSPPKRSPPLPWTHQETLALIQAYQEKWHSLKKGQLKAFQWEEVSITVAARCGFDEPSKTATQCRHKIEKLRKRYRSELQKPYLNSWQYFELMDQMERGPMPLDARPITIAKSFPNNTSSNSNNNNNVSNFSHGYSSLYPSSTEFYNNDGGGGGGGDSGVSDDSDEKWNTGHVPAAATRNKSKSINNIVRGDVRGGVRGAKGVAVERGFGGGGG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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