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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002136`

染色体: Chr01 坐标: 37344439-37346896 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002136`
名称	SmilChr01G002136
描述	uncharacterized SmilChr01G002136
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	37344439 - 37346896 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023691`
GeneID	`131023691`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023691`
原始查询	`SmilChr01G002136`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826929]; symbol=AT4G13150; hit=AT4G13150; species=arabidopsis; confidence=high
产物	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826929]; symbol=AT4G13150; hit=AT4G13150; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G13150` (AT4G13150) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826929] identity=60.5; qcov=0.908; evalue=1e-135; confidence=high
Rice	`Os02g0187300` - identity=65.7; qcov=0.095; evalue=6.12e-07; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF09335 (VTT_dom)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023691

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057809244.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	1.00000	`XP_057809244.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057809244.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809244.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809244.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:37344849`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B4,B94,D10,D3
`Chr1:37346260`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809244.1

368 aa

184

368

VTT_dom

PF09335 VTT_dom 221-324 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809244.1`	Pfam	`PF09335`	VTT_dom	Domain	221	324	1.6e-09	39.0	VTT domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009101481.1
AAACAAAACTGATTATCTCCGCCCAAACACGTGGCCCAATGTCAACGGATTTGGGCCCACCGGAAAGCCCAGCCACCACCTCTCTTAGTCTTATCAACCTCCGCCACTTTTCGGCCTGCGCCGTCGTCGCAGCAGCCATTCATGGCGGTTATTCTCGGTAACGGACCTTCTTCAGTCCTCGCTCTCCCGCGCCCGCCGCGCCGCTCCGCCAACAACCGGCGACTGCATTTCGGCCGTTCAATTAACCGTTCCAGAATTCT...

XM_057953261.1
AACAAAACTGATTATCTCCGCCCAAACACGTGGCCCAATGTCAACGGATTTGGGCCCACCGGAAAGCCCAGCCACCACCTCTCTTAGTCTTATCAACCTCCGCCACTTTTCGGCCTGCGCCGTCGTCGCAGCAGCCATTCATGGCGGTTATTCTCGGTAACGGACCTTCTTCAGTCCTCGCTCTCCCGCGCCCGCCGCGCCGCTCCGCCAACAACCGGCGACTGCATTTCGGCCGTTCAATTAACCGTTCCAGAATTCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023691
ATGGCGGTTATTCTCGGTAACGGACCTTCTTCAGTCCTCGCTCTCCCGCGCCCGCCGCGCCGCTCCGCCAACAACCGGCGACTGCATTTCGGCCGTTCAATTAACCGTTCCAGAATTCTCTCCGGCAATGCCAAAATCTTATCCAAATCATCGCGTTCTCGGATCTGTAGCTCTCAACGTGATGGTGCAGAAAAATCTGATGCTGTTCCAGAGGATCCAGTTAGGTTTTCTGTTGATAATGCTGCTGGAAGCTTAGATGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809244.1
MAVILGNGPSSVLALPRPPRRSANNRRLHFGRSINRSRILSGNAKILSKSSRSRICSSQRDGAEKSDAVPEDPVRFSVDNAAGSLDDKMGGSGSGSSFLSKLGIVLGIAAVITLVLIGVKPPNLGTSIGIQFLRDGTSSTLVSPSAAFSFRAFGFTVLLPEYAPGWIYFWLLMAAGCGLFISEEALNIWVGVTLARLICLDGTWKSLVDSFSRNAPYIFSTVLWVYWGVCISDMIPFYFGKMFRQSSASDDVLSKLGVGE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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