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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002137`

染色体: Chr01 坐标: 37346822-37351453 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002137`
名称	SmilChr01G002137
描述	probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At5g48740
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	37346822 - 37351453 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023685`
GeneID	`131023685`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023685`
原始查询	`SmilChr01G002137`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At5g48740
产物	probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At5g48740
Arabidopsis	`AT5G48740` (AT5G48740) Leucine-rich repeat protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834932] identity=61.7; qcov=0.99; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os11g0102900` - identity=34.8; qcov=1.02; evalue=1.01e-141; confidence=low
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF00560 (LRR_1); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr); PF11721 (Malectin); PF12819 (Malectin_like); PF13855 (LRR_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023685

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057809232.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057809232.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809232.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809232.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057809232.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:37347114`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	C1,C17,C31,C4,C49
`Chr1:37347182`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B94,C12,D3
`Chr1:37347463`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	C1,C17,C31,C4,C49
`Chr1:37348075`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:37348283`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr1:37348393`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,C23,D11
`Chr1:37348630`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	C1,C17,C31,C4,C49
`Chr1:37349596`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr1:37349728`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B113,B118,B25,C61
`Chr1:37349990`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B111,B77,C25,C34,D8
`Chr1:37350115`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,C23
`Chr1:37350141`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	C1,C17,C31,C4,C49

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809232.1

903 aa

452

903

Malectin_like

Malectin

LRR_8

LRR_1

PK_Tyr_Ser-Thr

Pkinase

PF12819 Malectin_like 32-346 aa PF11721 Malectin 195-308 aa PF13855 LRR_8 439-497 aa PF00560 LRR_1 462-484 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 617-825 aa PF00069 Pkinase 617-883 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809232.1`	Pfam	`PF12819`	Malectin_like	Domain	32	346	3.9e-47	161.9	Malectin-like domain
`XP_057809232.1`	Pfam	`PF11721`	Malectin	Domain	195	308	1.1e-06	29.5	Malectin domain
`XP_057809232.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	439	497	1.5e-07	31.8	Leucine rich repeat
`XP_057809232.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	462	484	2.3e-05	24.3	Leucine Rich Repeat
`XP_057809232.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	617	825	9.9e-46	156.8	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057809232.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	617	883	7.2e-45	154.2	Protein kinase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953249.1
AGACCGGAGCTCAATCATCACTCATAATTACTTGTCCCAAAAATAGCTTAATCTAACACAGCATGCAATGTAACGGTCAAAAGTTTACTTTTTTATTACTTCAATCAACAGCTTCACCTCTCATTGCTCTCTTCTTGCTTCCTCTCTCTCTTCTGCAACCTCTTCTCTCTCCTCAAGAACTAAATAGCATTAGTAGATTTCTGTGATCAACTGAGCTCACATTCCTACTTTATGGAGCATCGGTTCTTGAACTGCCTTAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023685
ATGGAGCATCGGTTCTTGAACTGCCTTAGCTTATTACTATTTTCAGCATGCATCAGGCTCACTCTATGCTACCAAGATGGATTCTTGAGCTTAACATGCGGCGGAAGCGTGAGCTATGTGGATTCCTCCAACGTTTCATGGAGAGGAGATGGATATTATGTGAACAAAGGGAACTTGAGCAGTGTTGTTTTCTCAGAGGGTGCGTCCTCGGCCACTCTCTCTGTCCGATTCTTCCCTGATTCTTCGGGCAGAAATTGCTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809232.1
MEHRFLNCLSLLLFSACIRLTLCYQDGFLSLTCGGSVSYVDSSNVSWRGDGYYVNKGNLSSVVFSEGASSATLSVRFFPDSSGRNCYRLPLQNTSSLVLVRSKFVYKNYDGLAKPPVFSVSLGTAITTTVNLAHTDPWIEEFVWPASKDVLPLCFHSIPNGGFPVISTLELRPLPPGAYSAALGDWSSKLMRKAYRINCGYVDGPLRYPLDPYDRIWDADEDFSPYHVSSGFDIESNFSLSGIKESPPSAILQTGRVLAR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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