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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002147`

染色体: Chr01 坐标: 37456800-37462681 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002147`
名称	SmilChr01G002147
描述	uncharacterized SmilChr01G002147
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	37456800 - 37462681 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023868`
GeneID	`131023868`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023868`
原始查询	`SmilChr01G002147`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	proteinase inhibitor I4, serpin (DUF716) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841967]; symbol=AT1G55240; hit=AT1G55240; species=arabidopsis; confidence=high
产物	proteinase inhibitor I4, serpin (DUF716) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841967]; symbol=AT1G55240; hit=AT1G55240; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G55240` (AT1G55240) proteinase inhibitor I4, serpin (DUF716) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841967] identity=52.1; qcov=0.986; evalue=1.98e-99; confidence=high
Rice	`Os09g0444900` - identity=54.2; qcov=0.91; evalue=1.22e-87; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04819 (DUF716)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023868

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057809482.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057809482.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057809482.1`
4	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057809482.1`
5	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057809482.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:37457044`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C18,C75
`Chr1:37457183`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,C15
`Chr1:37457223`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:37457289`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	12	A13,B100,B104,B105,B125,B131,B51,B77,C24,C3,C35,C81
`Chr1:37457432`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B13
`Chr1:37457432`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B13
`Chr1:37457439`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	15	A13,B101,B104,B105,B118,B125,B131,B137,B26,B77,C17,C3,C35,C81,D10
`Chr1:37457442`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:37457447`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	14	A13,B101,B104,B105,B118,B125,B131,B137,B26,B77,C17,C35,C81,D10
`Chr1:37462249`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B26,B47,B68,C46,C75
`Chr1:37462256`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	12	B106,B26,B47,B68,B87,C16,C42,C46,C68,C72,C75,D5
`Chr1:37462278`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809482.1

290 aa

145

290

DUF716

PF04819 DUF716 120-256 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809482.1`	Pfam	`PF04819`	DUF716	Family	120	256	8.5e-46	155.7	Family of unknown function (DUF716)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953499.1
CAATTTAGCTGTATAAATTGACTCAATCCCCATGCTTCCCACAACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCATTAAGCATGGGGAGCCTGCGCGGCCACATCGGACCGGGACTAGCCTTCTGCATCATCGGCCTATGGCATCTCTTCAACCACACCAAACTCCACGCCACAAACCCTAATTCCTACATCTCCCATCCATTTTTCCCCATTTCCAAATTCAAACACCTCGAGCTCCACTTCATCATCTTCGCCACCCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023868
ATGGGGAGCCTGCGCGGCCACATCGGACCGGGACTAGCCTTCTGCATCATCGGCCTATGGCATCTCTTCAACCACACCAAACTCCACGCCACAAACCCTAATTCCTACATCTCCCATCCATTTTTCCCCATTTCCAAATTCAAACACCTCGAGCTCCACTTCATCATCTTCGCCACCCTCACCTCCATCTCCATGGAACTCTTCATCCTTCCCCACCGCCACCACCCCTTCGCCCCCGACGGCTCCATCCCCTCCAACCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809482.1
MGSLRGHIGPGLAFCIIGLWHLFNHTKLHATNPNSYISHPFFPISKFKHLELHFIIFATLTSISMELFILPHRHHPFAPDGSIPSNHLHNLEHSAISLAFLTYAASAVALDRIAPPARSALTHLLAAAAFQQELLLFHLHSTDHAGLEGRYHWLLQLLILASLAVTVLSLADSRSFLLGFVRSLLIFAQGVWLVVIGVMLYTPRLMPKGCAVGLDDGHYVVRCDGGEAVERAKSLAAILFSYYVVAVAVFGVLFYLCLVK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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