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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002148`

染色体: Chr01 坐标: 37474486-37476248 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002148`
名称	SmilChr01G002148
描述	uncharacterized SmilChr01G002148
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	37474486 - 37476248 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023874`
GeneID	`131023874`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023874`
原始查询	`SmilChr01G002148`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	proteinase inhibitor I4, serpin (DUF716) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841966]; symbol=AT1G55230; hit=AT1G55230; species=arabidopsis; confidence=high
产物	proteinase inhibitor I4, serpin (DUF716) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841966]; symbol=AT1G55230; hit=AT1G55230; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G55230` (AT1G55230) proteinase inhibitor I4, serpin (DUF716) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841966] identity=46.5; qcov=0.966; evalue=2e-88; confidence=high
Rice	`Os08g0462800` - identity=48.5; qcov=0.906; evalue=1.13e-85; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04819 (DUF716)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023874

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057809493.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.60000	`XP_057809493.1`
3	Vacuole	液泡	0.60000	`XP_057809493.1`
4	Vacuole membrane	液泡膜	0.60000	`XP_057809493.1`
5	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.40000	`XP_057809493.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:37474745`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B53,B93
`Chr1:37474825`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:37474987`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B114,B81,C21,C7
`Chr1:37475030`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B55,B7,B82,C45,C48
`Chr1:37475064`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C18,C75
`Chr1:37475100`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A6,B137,B63,B79,D1
`Chr1:37475633`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C18,C75
`Chr1:37475635`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11
`Chr1:37475663`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B53,B93
`Chr1:37475663`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B53,B93
`Chr1:37475668`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A24,A4,B60,B75,B81
`Chr1:37475731`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B114,B32,C47

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809493.1

298 aa

149

298

DUF716

PF04819 DUF716 118-256 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809493.1`	Pfam	`PF04819`	DUF716	Family	118	256	7.6e-44	149.4	Family of unknown function (DUF716)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953510.1
GCTCTAGACGAAATCTGTTAACATATATGACAGTAGCATACCAGCACCACCTCAGAGACCAGCTTACAACTCTCTCTCGATCTCTCTCTCTCATCAAAAACAATTCCCATCTCTCTAAAACCAGAAAACTTACATAAAACAAAAGAAAAGGAGTGAAAATGGGGAATCTGAGAGGGCATGTGGTGTACGGAGCTGGTTTCTCTCTCATCGGTCTATGGCACCTCATCAACCACTCCAAACTCCACACTCTCAACCCCAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023874
ATGGGGAATCTGAGAGGGCATGTGGTGTACGGAGCTGGTTTCTCTCTCATCGGTCTATGGCACCTCATCAACCACTCCAAACTCCACACTCTCAACCCCAACTCCTTCACCGCCCTAACATGGTTCCCCACTTCAAGAATCAAATTCTTGGAGCTCTACTTCATCATGGCCGCCTCCCTCGCCGCCGTCTTCATGGACCTCTTCGGCGGCCTGCGCCGCCACCAACCCCTTGACGCCGACGGCACCATCCCCTCCTCTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809493.1
MGNLRGHVVYGAGFSLIGLWHLINHSKLHTLNPNSFTALTWFPTSRIKFLELYFIMAASLAAVFMDLFGGLRRHQPLDADGTIPSSHFHSFEHSVIALSIFAYALCAFLIEKTPANRGLSNAMAAVALAVELLVFHVHSADHMGVEGQYHLLLQAVIGTTLAATLLSSAGCDQSFSVAYVRSVGIAFQGVWLVNMGFMLWTPRLIFRGCFMNLEEGSNFVVRCEGEEALERARSLVNIQFSLFVVGVNVVAVVIYLAIFK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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