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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002152`

染色体: Chr01 坐标: 37512562-37514688 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002152`
名称	SmilChr01G002152
描述	transcription initiation factor TFIID subunit 7-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	37512562 - 37514688 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023888`
GeneID	`131023888`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023888`
原始查询	`SmilChr01G002152`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription initiation factor TFIID subunit 7-like
产物	transcription initiation factor TFIID subunit 7-like
Arabidopsis	`AT1G55300` (TAF7) TBP-associated factor 7 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841975] identity=64.6; qcov=1.03; evalue=6.43e-89; confidence=high
Rice	`Os05g0347000` - identity=61; qcov=1.02; evalue=2.78e-64; confidence=high
GO	GO:0005669 (transcription factor TFIID complex); GO:0006367 (transcription initiation at RNA polymerase II promoter); GO:0016251 (RNA polymerase II general transcription initiation factor activity); GO:0051123 (RNA polymerase II preinitiation complex assembly)
KEGG	smil03022 (Basal transcription factors - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF04658 (TAFII55_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023888

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057809510.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057809510.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809510.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809510.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057809510.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:37513396`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	C1,C17,C31,C4,C49
`Chr1:37513425`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A23
`Chr1:37513425`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A23
`Chr1:37513428`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr1:37513438`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr1:37513615`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:37513627`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:37513632`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C16
`Chr1:37513636`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:37513886`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A1
`Chr1:37513911`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C3
`Chr1:37514313`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B47

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809510.1

200 aa

100

200

TAFII55_N

PF04658 TAFII55_N 1-139 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809510.1`	Pfam	`PF04658`	TAFII55_N	Family	1	139	3.6e-33	115.2	TAFII55 protein conserved region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953527.1
AAGTACTAATAATAATCTCAAACTATTCTTCTAAAAAAAAATAAAAATAAAATCTACCTCTAATTATTCGCCGTCGACACTGCGCTCTCTCCTTCCCTCTCTCCGTGGGATGACTTCACATCTCTTCTGCTATAAGATGTTGGGATTTGGCAAAAAATAAGTAGTATTGTTTGGGAACATATTGTGTTGTTGTGAGAGAAAAATTGAAGGACATGGAAGAGCAGTTTATACTGAGAGTGCCACCAGCTGTTGCCGAAAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023888
ATGGAAGAGCAGTTTATACTGAGAGTGCCACCAGCTGTTGCCGAAAGAATTGAGCGACTCTTAAATGATTCATCTGCTTCTTCTGAAGACAAGAACTTGGATATGGTGTTTTCTGAGGATGGAAGGACTGGTACATTTGTTATAGGCAATGACCGCTTCTCTTCATCCCTCTTGGATCTTCCTTCCGTTGTAGAGTCGTACAAGACTTACGATGACAATGTCTTGATTAAAACTGCAGACATTGGTCAAATGATAATGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809510.1
MEEQFILRVPPAVAERIERLLNDSSASSEDKNLDMVFSEDGRTGTFVIGNDRFSSSLLDLPSVVESYKTYDDNVLIKTADIGQMIMVRDESDGVPEAVEYRHGLTPPMRDARRRRFRREPDLNPEVVRRVERDLQNIMAGGTAESIGVEMVEPEEYGDEDARNASKMVASTPLAKPDAPEAGTVGGEPDGSDSDETDDSM

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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