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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002157`

染色体: Chr01 坐标: 37583204-37586022 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002157`
名称	SmilChr01G002157
描述	BTB/POZ domain-containing protein At1g21780-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	37583204 - 37586022 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023909`
GeneID	`131023909`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023909`
原始查询	`SmilChr01G002157`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	BTB/POZ domain-containing protein At1g21780-like
产物	BTB/POZ domain-containing protein At1g21780-like
Arabidopsis	`AT1G21780` (AT1G21780) BTB/POZ domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838782] identity=69.7; qcov=1.01; evalue=1.39e-175; confidence=high
Rice	`Os08g0103600` - identity=65.4; qcov=0.889; evalue=5.83e-135; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00651 (BTB)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023909

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057809540.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057809540.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057809540.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809540.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809540.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:37584841`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr1:37584874`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr1:37585167`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C82
`Chr1:37585387`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B21,B32
`Chr1:37585455`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:37585461`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,B135,B53,C65
`Chr1:37585512`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr1:37585608`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B138
`Chr1:37585635`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr1:37585710`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C16

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809540.1

325 aa

162

325

BTB

PF00651 BTB 152-256 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809540.1`	Pfam	`PF00651`	BTB	Domain	152	256	1.6e-24	86.9	BTB/POZ domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953557.1
TTGGTTGAAAATTTTTAGGCTTAACTTGATACTACTCCACAAATTTGGGGCAGGATGGATATCCCTAATTTTACATGCCATTATTCCTTTAATTTATTTACCTAATTACTTACGACGGGTACGGCCGCACAGTGTCAAAGTCAAACAGAAAAGAATCCCCAATCGGCAGCAACATACGACATAGGAGAAAGAAAGCTACAGACATTGAGCACAAAAATACGATCTCGATTCTACACAAAGTCAAAATCCCTATATCTCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023909
ATGGTGGATACGAAGGTGGAGACTATAGCACGACACGCGCAGTGGAAAATCGAGAGCTTCGGGCCTACCGTTCCGTACAGAAGATCCGACCCCTTTAAGATCGGTATTTGGAACTGGCATTTATCAGTGGAGAAGAGCCGGGCAATCTACGTCCGGCTCTTCCCCGAACCGTCCCGGGTTGCCAAGGACCAGCCGCCGCTTGCCCGGTTCGTCGTCCGCGTCACCAACGCCGGCCGTAGAACTTATATCTCTCCCATTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809540.1
MVDTKVETIARHAQWKIESFGPTVPYRRSDPFKIGIWNWHLSVEKSRAIYVRLFPEPSRVAKDQPPLARFVVRVTNAGRRTYISPIHEKVLRTSDDFICLIDMNIQGRFVIDLEFLDLKISPLNGGDGSSIWPSEDTTRNLATQSTLKSLSRMLDESLLTDITINTADGKLHAHRAILSASSPVFHSMFLHDLKEKESSTIDIEDMSSESCTALLSYIYGTINQDDFWKHRLALLGAANKYDIVDLKDSCEESLLEDINM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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