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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002162`

染色体: Chr01 坐标: 37629667-37631655 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002162`
名称	SmilChr01G002162
描述	photosystem II 22 kDa protein, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	37629667 - 37631655 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023958`
GeneID	`131023958`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023958`
原始查询	`SmilChr01G002162`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	photosystem II 22 kDa protein, chloroplastic
产物	photosystem II 22 kDa protein%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT1G44575` (NPQ4) Chlorophyll A-B binding family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841033] identity=71.8; qcov=1.04; evalue=6.1e-106; confidence=high
Rice	`Os01g0869800` (PSBS1) - identity=76.1; qcov=1.02; evalue=3.97e-126; confidence=high
GO	-
KEGG	smil00195 (Photosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00504 (Chloroa_b-bind)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023958

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057809614.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057809614.1`
3	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	1.00000	`XP_057809614.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057809614.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809614.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:37631067`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B137,B19,B21,B53,B99
`Chr1:37631166`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809614.1

263 aa

132

263

Chloroa_b-bind

PF00504 Chloroa_b-bind 84-207 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809614.1`	Pfam	`PF00504`	Chloroa_b-bind	Family	84	207	3.2e-10	41.4	Chlorophyll A-B binding protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953631.1
ATATTACTAAGTTTATGTCCAAAAAAAGACAAAAAGCAAAAAACAAAAGAGAGAGGTAGAGAAGAAGAAGTTGATAGTCTCTCTCTCCAACCAACAAATTTGCAAAATTGAAAAACGAAGGTCTCGTGGATGCACTGAGCACCATGACTCCTCCCTCATACCCTATCCACATCACTACCCATTTGTGTGACTCACAAACTCTCCTCACTAGATTTGCTGCAATAAATAAAGCAAACAAACCTTAACCATTCCCACATTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023958
ATGGCTCAAACAATGCTGCTCACTGCAAATCCCTTGTTGAAGGGTGAGCAGCCATCCTTGATCCAAAGGCTTAAACCTCAGCCCTTCTCTCAGATCTGCAGGATTAACACTGCTTCGCCTCTCTCTTCCTCAACCACTACTGTTGCTCTCTTCAAATCCAAAGCCAAAGCTGCTCCTGCTAAGAAGGTAGTAGTGAAGGAAAAGACTAAGGTTGAAGATGGGATTTTTGGGACATCTGGTGGGATTGGATTTACTAAACA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809614.1
MAQTMLLTANPLLKGEQPSLIQRLKPQPFSQICRINTASPLSSSTTTVALFKSKAKAAPAKKVVVKEKTKVEDGIFGTSGGIGFTKQNELFVGRVAMIGFAASLLGEAITGKGILQQLNLETGIPIYEAEPLLLFFILFTLLGAIGALGDRGRFVDDAPATGLDKAVIAPGKGLRAALGLGDGPLFGFTKANELFVGRLAQLGIAFSLIGEIITGKGALAQLNIETGVPIGELEPLLLFNIVFFFVAAINPGTGKFVTDD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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