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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002171`

染色体: Chr01 坐标: 37804524-37808319 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002171`
名称	SmilChr01G002171
描述	lysM domain-containing GPI-anchored protein 1-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	37804524 - 37808319 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024055`
GeneID	`131024055`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024055`
原始查询	`SmilChr01G002171`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	lysM domain-containing GPI-anchored protein 1-like
产物	lysM domain-containing GPI-anchored protein 1-like
Arabidopsis	`AT1G21880` (LYM1) lysm domain GPI-anchored protein 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838790] identity=64.3; qcov=0.947; evalue=1.24e-178; confidence=high
Rice	`Os06g0208800` (LysM1) - identity=58.5; qcov=0.89; evalue=2.03e-143; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF01476 (LysM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024055

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057809631.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057809631.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809631.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809631.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057809631.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:37804845`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B4
`Chr1:37804845`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B4
`Chr1:37804848`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C8
`Chr1:37804848`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C8
`Chr1:37804851`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C8
`Chr1:37804851`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C8
`Chr1:37804909`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C32,C68,C8
`Chr1:37805000`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D1
`Chr1:37805008`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B21,B56,B96
`Chr1:37805191`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B137,B21
`Chr1:37805407`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:37806735`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C78

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809631.1

417 aa

208

417

LysM

PF01476 LysM 105-154 aa PF01476 LysM 174-208 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809631.1`	Pfam	`PF01476`	LysM	Domain	105	154	4.1e-15	56.2	LysM domain
`XP_057809631.1`	Pfam	`PF01476`	LysM	Domain	174	208	4.1e-15	56.2	LysM domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953648.1
TGTGCGTAGGATCTTGGTTTTGGACACGAAGATCGAGAAGCTGACCACTGTCTCAATTCCCTCTCTCTCACACACACATACACACATTGAGAAGAGCCTGAAAACTCCCACGCGCACACACACACACACACACAGTTTCAAAAAACACCTTTGTCCCCTCCGCTTGCTCTCTTCTGGGTTTATGCCCTACTCCCTTCTCTCTTTGAAATTCCTTTACTCAGCACACACTCACACACCCAACAGTCAACAGTCCTTTGTCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024055
ATGCCGCCGCCGCTCGCCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTGGCCCCACCCAGCTCCTCAAAATCCACCATCGAGCCCTGCTCCAACTCCGACTCCTGCTCCGCCCTGGTGGGCTACACACTGTACACGGACCTGAAGGTCTCGGAGGTGGCCTCCCTCTTCTCGGTGGACCCCATCGCCCTCCTCCTCGCCAACTCCATCGACATCTCCCCTCCCGACGTGGAGAACCACATCCTCCCCTCCCAGCTCTTCCTCAAGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809631.1
MPPPLALLLLLLLLAPPSSSKSTIEPCSNSDSCSALVGYTLYTDLKVSEVASLFSVDPIALLLANSIDISPPDVENHILPSQLFLKIPVTCACVDGIRKSSAVTYKTRPADTLASISAAVYGGIVSPDQIRDANPKADLSDPSVIAVGTPLSVPLPCTCFNNSDNNLPAVYMSYVVKDVDTLSGIAARYATTVTDLMNVNALSSAEIKDADILAIPLSACASNFPNYSSDYGLVVPNGSYAITAGHCVQCSCGPGSRNLY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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