当前解析结果
SmilChr01G002172| 统一新 Gene ID | SmilChr01G002172 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G002172 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G002172 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 37810859 - 37813346 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131024071 |
|---|---|
| GeneID | 131024071 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131024071 |
| 原始查询 | SmilChr01G002172 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | elongation factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841041]; symbol=AT1G44770; hit=AT1G44770; species=arabidopsis; confidence=high |
| 产物 | elongation factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841041]; symbol=AT1G44770; hit=AT1G44770; species=arabidopsis; confidence=high |
| Arabidopsis | AT1G44770 (AT1G44770)elongation factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841041] identity=51.5; qcov=1.02; evalue=3.09e-94; confidence=high |
| Rice | Os03g0701600- identity=38.2; qcov=1.03; evalue=1.15e-56; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131024071 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Mitochondrion outer membrane | 线粒体外膜 | 0.60000 | XP_057809632.1 |
| 2 | Mitochondrion | 线粒体 | 0.40000 | XP_057809632.1 |
| 3 | Mitochondrion membrane | 线粒体膜 | 0.40000 | XP_057809632.1 |
| 4 | Lipid droplet | 脂滴 | 0.40000 | XP_057809632.1 |
| 5 | Nucleus membrane | 核膜 | 0.20000 | XP_057809632.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:37811962 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B1 |
Chr1:37812442 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。