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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002173`

染色体: Chr01 坐标: 37813497-37814579 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002173`
名称	SmilChr01G002173
描述	uncharacterized SmilChr01G002173
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	37813497 - 37814579 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007745`
GeneID	`131007745`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007745`
原始查询	`SmilChr01G002173`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820108]; symbol=AT3G09510; hit=AT3G09510; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820108]; symbol=AT3G09510; hit=AT3G09510; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G09510` (AT3G09510) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820108] identity=25.6; qcov=0.732; evalue=1.4e-10; confidence=low
Rice	`Os02g0118800` - identity=25.9; qcov=0.68; evalue=8.25e-10; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007745

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057790634.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057790634.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057790634.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790634.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790634.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:37813508`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B132,B44,B6,B87,C67
`Chr1:37813518`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B132,B44,B87,C67
`Chr1:37813523`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B132,B44,B87,C67
`Chr1:37813611`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B137,B19,B21
`Chr1:37813614`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	20	B106,B128,B129,B17,B38,B39,B40,B47,B53,B55,B62,B82,B98,C23,C30,C47,C48,C51,C75,D2
`Chr1:37813645`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B129,B38,B39,B53,C23
`Chr1:37813713`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	9	B10,B102,B122,B123,B30,C20,C34,C39,C79
`Chr1:37813714`	`CAG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	32	A20,A21,A22,A24,B119,B136,B17,B18,B29,B44,B51,B58,B62,B67,B83,B93,B95,B99,C10,C12,C14,C15,C27,C33,C46,C5,C50,C56,C74,C77,C9,D4
`Chr1:37813728`	`CCA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	B129,B38,B39,B53,C23
`Chr1:37813728`	`CCA`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	5	B129,B38,B39,B53,C23
`Chr1:37813818`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C32,C68,C8
`Chr1:37813830`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	42	A7,B10,B102,B106,B118,B122,B123,B128,B132,B17,B2,B21,B27,B28,B30,B40,B44,B47,B48,B54,B55,B6,B60,B62,B76,B82,B87,B93,B94,B96,B98,C12,C15,C20,C30,C34,C39,C48,C67,C70,C79,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790634.1

272 aa

136

272

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 87-156 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790634.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	87	156	2.2e-14	54.6	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934651.1
ATGGAAAGGTTTAACAAGGCTTTGATGGCCAAATGGATATGGCGTTTCCTCACTGAGAAAGACTCTTTATGGGCTCGAGTGGTTAGGGCATGTAAGGGAGAAATGAATTGGGATGAAGGAGGCTTTAGGATCGATGGGCATCGGGATATGAGGGCGGGTTGGTGGAAAAAGGTTCTGAGCTCCATAGTAAATGAAGGAAAACCCGACGGCTGGAAATGGAAAGCAACTCCAAATGGAATCTTTATGAGCAAAGGACTAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007745
ATGGAAAGGTTTAACAAGGCTTTGATGGCCAAATGGATATGGCGTTTCCTCACTGAGAAAGACTCTTTATGGGCTCGAGTGGTTAGGGCATGTAAGGGAGAAATGAATTGGGATGAAGGAGGCTTTAGGATCGATGGGCATCGGGATATGAGGGCGGGTTGGTGGAAAAAGGTTCTGAGCTCCATAGTAAATGAAGGAAAACCCGACGGCTGGAAATGGAAAGCAACTCCAAATGGAATCTTTATGAGCAAAGGACTAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790634.1
MERFNKALMAKWIWRFLTEKDSLWARVVRACKGEMNWDEGGFRIDGHRDMRAGWWKKVLSSIVNEGKPDGWKWKATPNGIFMSKGLDFKRIWKAPTAHKAKTTAWRIMNGKMATVDNLLKRKVPFPNSEHICALCQVPPENTNHLFFSCQKSAEIWYELLSWFGKQSVLQSNAIDQYLAFTNIGHKKDAHFLVGVWICTVWSIWKERNELRFNNGKWDKGKMVADIKSRLWSWKQAYNMNTAPDDFRSWFIAVRLENSAS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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