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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002182`

染色体: Chr01 坐标: 37950605-37953414 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002182`
名称	SmilChr01G002182
描述	uncharacterized SmilChr01G002182
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	37950605 - 37953414 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024202`
GeneID	`131024202`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024202`
原始查询	`SmilChr01G002182`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Pyridoxal phosphate (PLP)-dependent transferases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844103]; symbol=AT1G77670; hit=AT1G77670; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Pyridoxal phosphate (PLP)-dependent transferases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844103]; symbol=AT1G77670; hit=AT1G77670; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G77670` (AT1G77670) Pyridoxal phosphate (PLP)-dependent transferases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844103] identity=82.8; qcov=0.858; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os09g0453800` (OsIDI4) - identity=81.6; qcov=0.828; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005737 (cytoplasm); GO:0009058 (biosynthetic process); GO:0016212 (L-kynurenine:2-oxoglutarate transaminase activity); GO:0030170 (pyridoxal phosphate binding)
KEGG	smil00270 (Cysteine and methionine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00155 (Aminotran_1_2); PF00266 (Aminotran_5); PF01041 (DegT_DnrJ_EryC1); PF01053 (Cys_Met_Meta_PP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024202

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057809695.1`
2	Mitochondrion	线粒体	0.80000	`XP_057809695.1`
3	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.40000	`XP_057809695.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057809695.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809695.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:37950886`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B94,C12
`Chr1:37950948`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C33
`Chr1:37951045`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr1:37951076`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A9,B18,B61,B65
`Chr1:37951077`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,C74
`Chr1:37951098`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B115,B20,B56,B96
`Chr1:37951110`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr1:37951123`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A1
`Chr1:37951156`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B25
`Chr1:37951165`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B120,C13
`Chr1:37951227`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,B41
`Chr1:37951285`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B128

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809695.1

466 aa

233

466

Aminotran_1_2

Aminotran_5

Cys_Met_Meta_PP

DegT_DnrJ_EryC1

PF00155 Aminotran_1_2 108-457 aa PF00266 Aminotran_5 163-279 aa PF01053 Cys_Met_Meta_PP 167-279 aa PF01041 DegT_DnrJ_EryC1 169-277 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809695.1`	Pfam	`PF00155`	Aminotran_1_2	Domain	108	457	2.8e-69	234.7	Aminotransferase class I and II
`XP_057809695.1`	Pfam	`PF00266`	Aminotran_5	Domain	163	279	5.2e-06	26.4	Aminotransferase class-V
`XP_057809695.1`	Pfam	`PF01053`	Cys_Met_Meta_PP	Domain	167	279	5.7e-09	35.7	Cys/Met metabolism PLP-dependent enzyme
`XP_057809695.1`	Pfam	`PF01041`	DegT_DnrJ_EryC1	Domain	169	277	4.2e-07	30.2	DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953712.1
AATTAATGGAGGACAAATTCACTACAAATACAGATCGAAAAAAATAAATAAACGTTTTAATATGGCAAATGTCTGCTCGTGGACTCGTCTTTATATGGCAATTTGGTAATGAAATCCCAAATTGATTCATCAAATCCCTAAATCAAAGAACAGCATTCAAGCTCATGCTCCACTCCACTTCTTCTCATCAAATGTTTAGACCACACATGGTTAAACCCATCAAATTTTCCCAAATATTTTCCAATAACATAGGCATAAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024202
ATGCTCCACTCCACTTCTTCTCATCAAATGTTTAGACCACACATGGTTAAACCCATCAAATTTTCCCAAATATTTTCCAATAACATAGGCATAAAGTTAGGAATTTCTGCAGGTCACAGCTTCCGCTGCAGCTTGAGGATTCCACCAATCATGGCTACTTCAATTTCCACTGCCGCCACGACTCAGCAGCAGCACGTTTCAACTCAGAGCGAGTCGTCTCCGAACTCTGCGACTCGGCCTCTCCAGATTGCGAAGCGGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809695.1
MLHSTSSHQMFRPHMVKPIKFSQIFSNNIGIKLGISAGHSFRCSLRIPPIMATSISTAATTQQQHVSTQSESSPNSATRPLQIAKRLEKFKTTIFTQMSSLAIKHGAINLGQGFPNFDGPEFVKEAAIEAIRDGKNQYARGYGVPDLNSAVADRFRIDTGLVVDPEKEVTVASGCTEAIAATILGLINPGDEVVVFAPFYDSYEATLSMAGAKIKSITLKPPDFSVPIDELKSAVTKNTRAILMNTPHNPTGKMFTTKEL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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