当前解析结果
SmilChr01G002192| 统一新 Gene ID | SmilChr01G002192 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G002192 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G002192 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 38062705 - 38063397 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131024300 |
|---|---|
| GeneID | 131024300 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131024300 |
| 原始查询 | SmilChr01G002192 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131024300 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057809800.1 |
| 2 | Nucleoplasm | 核质 | 0.60000 | XP_057809800.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057809800.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057809800.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057809800.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:38062794 |
GTA |
G |
2bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B41 |
Chr1:38062794 |
GTA |
G |
2bp_deletion | CDS_variant | 1 | B41 |
Chr1:38062884 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B28,C1 |
Chr1:38062918 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B2,B24,B66,B95,C40 |
Chr1:38062944 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C16 |
Chr1:38062970 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B47,C48,D7 |
Chr1:38063069 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B111,B77,C34,D8 |
Chr1:38063070 |
G |
GT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 122 | A13,A2,A22,A24,A25,A3,A4,A5,A6,A7,A9,B100,B102,B103,B105,B106,B108,B112,B114,B119,B120,B124,B127,B128,B132,B133,B135,B137,B14,B15,B16,B2,B20,B21,B24,B25,B26,B3,B35,B38,B39,B41,B42,B44,B53,B54,B55,B58,B59,B6,B63,B66,B67,B69,B7,B71,B73,B74,B75,B77,B78,B79,B84,B88,B89,B9,B93,B95,B97,B98,C1,C11,C16,C18,C19,C21,C22,C25,C26,C28,C3,C30,C31,C33,C34,C37,C40,C44,C46,C47,C5,C50,C53,C54,C55,C56,C57,C6,C60,C63,C64,C66,C67,C69,C71,C72,C73,C74,C77,C8,C80,C81,C82,C84,C86,C87,D1,D2,D3,D5,D6,D9 |
Chr1:38063248 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A23 |
Chr1:38063259 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A20 |
Chr1:38063264 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A9,B18,B31,B61,B65 |
Chr1:38063267 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B47,C48,D7 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。