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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002194`

染色体: Chr01 坐标: 38103707-38105740 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002194`
名称	SmilChr01G002194
描述	uncharacterized SmilChr01G002194
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	38103707 - 38105740 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024320`
GeneID	`131024320`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024320`
原始查询	`SmilChr01G002194`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os11g0577650; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os11g0577650; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G41980` (AT5G41980) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834203] identity=37.8; qcov=0.844; evalue=8.67e-49; confidence=medium
Rice	`Os11g0577650` - identity=52.2; qcov=0.702; evalue=3.93e-70; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13359 (DDE_Tnp_4); PF26138 (DUF8040)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024320

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057809810.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809810.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809810.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057809810.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057809810.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:38103772`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C23,C26
`Chr1:38103801`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:38103806`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	96	A1,A10,A11,A21,A24,A9,B104,B105,B106,B110,B111,B113,B118,B119,B12,B121,B122,B123,B124,B125,B135,B14,B18,B20,B21,B22,B25,B30,B31,B34,B36,B37,B40,B42,B43,B46,B49,B60,B61,B62,B65,B70,B74,B77,B78,B8,B83,B84,B88,B89,B90,B91,B92,B94,B95,B99,C10,C15,C18,C19,C25,C26,C28,C34,C35,C36,C38,C39,C40,C43,C5,C50,C51,C52,C53,C57,C58,C62,C64,C66,C70,C71,C75,C76,C78,C79,C80,C83,C87,C9,D1,D10,D11,D3,D4,D8
`Chr1:38103809`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	40	A11,A24,B105,B106,B113,B118,B124,B125,B135,B20,B21,B22,B25,B36,B46,B49,B60,B74,B79,B83,B90,B92,C10,C16,C18,C35,C36,C39,C53,C58,C62,C71,C75,C78,C79,C80,C87,D1,D3,D4
`Chr1:38103845`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B19,C37
`Chr1:38103856`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:38104053`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr1:38104058`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B111,B77,C25,D8
`Chr1:38104065`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B136,C5,D11
`Chr1:38104085`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D1
`Chr1:38104109`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	9	B17,B20,B29,B36,B81,B94,C43,C59,D1
`Chr1:38104121`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809810.1

295 aa

148

295

DUF8040

DDE_Tnp_4

PF26138 DUF8040 63-149 aa PF13359 DDE_Tnp_4 182-272 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809810.1`	Pfam	`PF26138`	DUF8040	Domain	63	149	2.3e-24	85.8	Domain of unknown function (DUF8040)
`XP_057809810.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	182	272	3.3e-08	34.0	DDE superfamily endonuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953827.1
TGTAGTGTTTTTATTGTACAGCTAGGCCCGTCCCAAAACGACGGCCCGGCCTTAAAACAACTGTTCAATCGGTGTTGTGGAATGGAGGCTCACCCTCGGTTCTAATTCCAATAAGTGCACAGTGATCAAGCTAATTTTTGGGCCTTCCAAAAATACCCCAAAATCAAAGTTAAAAAAAATGAAATCTCATTTCCCTCTTTCTTCCTTCTAATTTGAACGAGCTCTGCGTTCTTGGTCAAGGAGTGAAGAACCTGTTCCAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024320
ATGCTATCTCGACGCCGTGTAAATGGTTATGTTCACTCAATGGTCGAGGAGATTATGAATCATCTATTGTTGCAACTCACCGTTGTAATTGAACACATAGAAAGCGGTAAGTCTCGAAAGAGGAGGCGTTGTTTATCAAAAGAGCCTTACACCTTCTTGGCTCGTATTCCCGATCAAGTGAAACACATGGATCGGTTGGTTAACATAAGTGATGTTGATTGTATTGCTAACTTACGAATGGACCGCAATACCTTCGGGCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809810.1
MLSRRRVNGYVHSMVEEIMNHLLLQLTVVIEHIESGKSRKRRRCLSKEPYTFLARIPDQVKHMDRLVNISDVDCIANLRMDRNTFGRLCILLRQLGGLKDGRYVTVEEQVAMFLSVLAHHKKNRVVRFDFWRSGYTISRYIHVVLKAVLSLHILLFVKPQPVTDECADPRWKWFKGCLGALDSTYIDVMVSNGDKPRYRTRKGHISTNTLGVCDRNLKFVYVLPGWEGSAADSRVLRDALSRPNGLRVPKGNFYLCDNGY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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