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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002217`

染色体: Chr01 坐标: 38496276-38498860 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002217`
名称	SmilChr01G002217
描述	uncharacterized SmilChr01G002217
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	38496276 - 38498860 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014396`
GeneID	`131014396`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014396`
原始查询	`SmilChr01G002217`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	autophagy protein Apg5 family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831594]; symbol=APG5; hit=AT5G17290; species=arabidopsis; confidence=low
产物	autophagy protein Apg5 family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831594]; symbol=APG5; hit=AT5G17290; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G17290` (APG5) autophagy protein Apg5 family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831594] identity=64.7; qcov=0.354; evalue=7.25e-10; confidence=low
Rice	`Os02g0117800` (OsATG5) - identity=52.9; qcov=0.354; evalue=3.39e-07; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014396

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057798347.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057798339.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057798347.1`
4	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057798339.1`
5	Lipid droplet	脂滴	0.20000	`XP_057798339.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:38497369`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	9	A18,B22,B45,C38,C47,C51,C73,D11,D6
`Chr1:38497584`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,B66
`Chr1:38497585`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr1:38497825`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B120,B85,C44
`Chr1:38497825`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B120,B85,C44
`Chr1:38497857`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B24
`Chr1:38497857`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B24
`Chr1:38498333`	`CTT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	8	B107,B129,B29,B59,C28,C30,C74,D7
`Chr1:38498420`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	67	A13,A16,A18,A2,A21,A22,A25,A7,A8,B101,B103,B104,B105,B109,B110,B112,B120,B123,B13,B132,B136,B14,B16,B22,B23,B33,B35,B38,B39,B46,B47,B48,B49,B5,B51,B58,B59,B68,B71,B72,B73,B74,B75,B8,B81,B84,B89,B90,B92,B99,C13,C24,C28,C32,C44,C47,C48,C50,C55,C57,C61,C68,C75,C77,C82,C85,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

17 records

下载 cDNA FASTA

XR_009098214.1
GGATTCCCCACTAGTTAAAAACTTAAAACTTTTATGTTCTGAAATTTGAACGTGGCAAATTCCCCAAATTTCCCACTAATTAGCGGCAGTATTTTTTCAAAAGGCAAAGATAGTAAGAGAGGGAAATTTTCATTCTCCTGCCCTAGCCTCACCTACGAAGAGAACGAGAAGAAGAAAAATTGCTCGAATTTCCTTCCCAACCCAATGTCTATAATTCCCCTCAAAATTGATTTCGATTTGTTGGTGATTGGGAAAATCAA...

XR_009098206.1
TCCCCACTAGTTAAAAACTTAAAACTTTTATGTTCTGAAATTTGAACGTGGCAAATTCCCCAAATTTCCCACTAATTAGCGGCAGTATTTTTTCAAAAGGCAAAGATAGTAAGAGAGGGAAATTTTCATTCTCCTGCCCTAGCCTCACCTACGAAGAGAACGAGAAGAAGAAAAATTGCTCGAATTTCCTTCCCAACCCAATGTCTATAATTCCCCTCAAAATTGATTTCGATTTGTTGGTGATTGGGAAAATCAAAGAC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131014396
ATGGAGATTGTGATGGAAATGCACAGGAAGTATAAGTTCGTGCAACTGGATTTTTGGTATTCTTGCTGGCTAGCTTCCTGGGGATTGGAGCTTCTTTGTGCCATACATAGTGGGGAGCATCTCTTTTTGGTATTTCTTGCAATATGGAATCTCCTGAAAGGATATCCAGTAAATCTATTGATCCGTTGCGAAGGAGAAGACAATGTAAAGTGGGGCTTTATTAATGCCCTAAAAGAGAGGACATCAGAGAAGCAGCTATT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057798339.1
MEIVMEMHRKYKFVQLDFWYSCWLASWGLELLCAIHSGEHLFLVFLAIWNLLKGYPVNLLIRCEGEDNVKWGFINALKEVKYKFQYTFRYKFFEFRFVSYMNLFNTFH

XP_057798347.1
MEIVMEMHRKYKFVQLDFWYSCWLASWGLELLCAIHSGEHLFLVFLAIWNLLKGYPVNLLIRCEGEDNVKWGFINALKERTSEKQLFHTTHFSTKC

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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