当前解析结果
SmilChr01G002231| 统一新 Gene ID | SmilChr01G002231 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G002231 |
| 描述 | histone acetyltransferase of the MYST family 1 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 38794171 - 38798479 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131014517 |
|---|---|
| GeneID | 131014517 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131014517 |
| 原始查询 | SmilChr01G002231 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | histone acetyltransferase of the MYST family 1 |
| 产物 | histone acetyltransferase of the MYST family 1 |
| Arabidopsis | AT5G64610 (HAM1)histone acetyltransferase of the MYST family 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836582] identity=86.2; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high |
| Rice | Os07g0626600 (OsHAM701)- identity=93.1; qcov=0.89; evalue=0; confidence=high |
| GO | GO:0004402 (histone acetyltransferase activity); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0016573 (GO:0016573) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF01853 (MOZ_SAS); PF11717 (Tudor-knot); PF17772 (zf-MYST) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131014517 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057798494.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.80000 | XP_057798494.1 |
| 3 | Nucleoplasm | 核质 | 0.20000 | XP_057798494.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057798494.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057798494.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:38795857 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A23,C54,C87 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057798494.1PF11717
Tudor-knot 53-111 aa
PF17772
zf-MYST 164-218 aa
PF01853
MOZ_SAS 222-417 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057798494.1 |
Pfam | PF11717 |
Tudor-knot | Family | 53 | 111 | 9e-20 | 71.1 | RNA binding activity-knot of a chromodomain |
XP_057798494.1 |
Pfam | PF17772 |
zf-MYST | Domain | 164 | 218 | 2.6e-25 | 88.5 | MYST family zinc finger domain |
XP_057798494.1 |
Pfam | PF01853 |
MOZ_SAS | Domain | 222 | 417 | 2.1e-96 | 322.1 | MOZ/SAS family |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。