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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002237`

染色体: Chr01 坐标: 38917033-38919220 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002237`
名称	SmilChr01G002237
描述	auxin response factor 17
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	38917033 - 38919220 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014684`
GeneID	`131014684`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014684`
原始查询	`SmilChr01G002237`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	auxin response factor 17
产物	auxin response factor 17
Arabidopsis	`AT1G77850` (ARF17) auxin response factor 17 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844120] identity=40.2; qcov=1.08; evalue=2.02e-122; confidence=medium
Rice	`Os06g0685700` (OsARF10) - identity=38; qcov=1.09; evalue=1.61e-100; confidence=medium
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0009725 (response to hormone)
KEGG	-
Pfam	PF02362 (B3); PF06507 (ARF_AD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014684

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057798720.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798720.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798720.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057798720.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057798720.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:38917416`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B56
`Chr1:38917416`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B56
`Chr1:38917539`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B139,D2
`Chr1:38917576`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr1:38917665`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C26
`Chr1:38918031`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C16
`Chr1:38918051`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	A16
`Chr1:38918051`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A16
`Chr1:38918575`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B134,B49
`Chr1:38918849`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C78
`Chr1:38918926`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B139,D2
`Chr1:38918998`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B127

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798720.1

512 aa

256

512

ARF_AD

PF02362 B3 126-228 aa PF06507 ARF_AD 268-350 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798720.1`	Pfam	`PF02362`	B3	Domain	126	228	1.3e-24	86.7	B3 DNA binding domain
`XP_057798720.1`	Pfam	`PF06507`	ARF_AD	Domain	268	350	8.3e-25	87.2	Auxin response factor ancillary domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942737.1
CTTACACACTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCATCAGGATATATACAGATATATATAAACAAAATATGCAGACGCCACCGCGACGTCCGCCGCCAACAATGCCTTCATCCTCATCCTCAACCGCCGCCGCCGAAGTCGACGCCAAAATCTGGCGAGCAGTCGCCGGCGCCGCCGTGCGCGTTCCCTCCGTCAATTCCTACGTCTACTACTTCCCCCAGGGGCACCTGGAGCAGTGCTCCGCCGCTGCAGCCGTCACTAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014684
ATGCAGACGCCACCGCGACGTCCGCCGCCAACAATGCCTTCATCCTCATCCTCAACCGCCGCCGCCGAAGTCGACGCCAAAATCTGGCGAGCAGTCGCCGGCGCCGCCGTGCGCGTTCCCTCCGTCAATTCCTACGTCTACTACTTCCCCCAGGGGCACCTGGAGCAGTGCTCCGCCGCTGCAGCCGTCACTAATCGCAATTTTACCCTAATGCGGCCGTGGTTTCCCTGCCAAATACTCTCCGTTCGATTCCTCTCTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798720.1
MQTPPRRPPPTMPSSSSSTAAAEVDAKIWRAVAGAAVRVPSVNSYVYYFPQGHLEQCSAAAAVTNRNFTLMRPWFPCQILSVRFLSDPASDQVYAKILLQPLQPLGPRPSNAAGGGAGDDDDVVSFAKILTRSDANNGGGFSVPRFCADMILPQLNFAADPPVQNLVLRDTHGHAWEFRHIYRGTPRRHLLTTGWSKFVNAKRLVAGDAVVFMKKRSTGELFVGIRRAERIGGDAAAEEAEAVAAIESAVRGMPFEAVYY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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