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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002241`

染色体: Chr01 坐标: 38953107-38956054 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002241`
名称	SmilChr01G002241
描述	uncharacterized SmilChr01G002241
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	38953107 - 38956054 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014735`
GeneID	`131014735`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014735`
原始查询	`SmilChr01G002241`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819606]; symbol=AT3G04500; hit=AT3G04500; species=arabidopsis; confidence=high
产物	RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819606]; symbol=AT3G04500; hit=AT3G04500; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G04500` (AT3G04500) RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819606] identity=82.5; qcov=0.778; evalue=9.06e-116; confidence=high
Rice	`Os08g0567200` - identity=78.4; qcov=0.724; evalue=8.39e-100; confidence=high
GO	GO:0003729 (mRNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014735

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057798800.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057798800.1`
3	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.20000	`XP_057798800.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798800.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798800.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:38953401`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:38953533`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:38953553`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A22,B29,B67,C14,C45
`Chr1:38953738`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr1:38955051`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B47
`Chr1:38955060`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr1:38955075`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr1:38955739`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77
`Chr1:38955783`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C3
`Chr1:38955884`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798800.1

243 aa

122

243

RRM_1

PF00076 RRM_1 137-207 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798800.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	137	207	2.7e-17	63.1	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942817.1
AACACGCTTTACCGGGTACGAATCCAATAGATTAGTCCATTCATTTTCATTTCAATTTTTACAATTCCGAATCCCCAAATCGCTCTTCTTCCGATCAACACACAGCCATCACGCCGCCGTTTCCTCTCCGTTTAATTGGGGTTTCTATGTCGAACTTGCATTCAACCACGGCGGCAGCCTCTTCATCGTCTAGCCAATACACCTACTCCGCTGCCACCACGCCCTATTTTCCGACGCCGTTTCACCTCCAACAAACGCCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014735
ATGTCGAACTTGCATTCAACCACGGCGGCAGCCTCTTCATCGTCTAGCCAATACACCTACTCCGCTGCCACCACGCCCTATTTTCCGACGCCGTTTCACCTCCAACAAACGCCTCCGCCGCCACCCGCTCCTTACATCGGGGCCGCCCCTCCTCCCCCTGTCCCGGTTCCCGTTTATCCCGCGCCTTCCACCGTCTACTCCTTGCCGCAGTATCAGCAGGCTCAACAGTTGTTTCAGAGAGATGCACAGACAATAACACC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798800.1
MSNLHSTTAAASSSSSQYTYSAATTPYFPTPFHLQQTPPPPPAPYIGAAPPPPVPVPVYPAPSTVYSLPQYQQAQQLFQRDAQTITPEALESVKAALANSDIEHKAETKKKAIPRKAAGQSWEDPTLAEWPENDYRLFCGDLGNEVNDDVLSKAFARFPSFNMARVVRDKRTGKTKGYGFISFANPSDLVGALKEMNGKYVGNRPIKLRKSTWTERTDTDALGRQKHHSQKKTKQPKRSILHK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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