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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002262`

染色体: Chr01 坐标: 39429772-39433601 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002262`
名称	SmilChr01G002262
描述	probable magnesium transporter NIPA6
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	39429772 - 39433601 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006451`
GeneID	`131006451`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006451`
原始查询	`SmilChr01G002262`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable magnesium transporter NIPA6
产物	probable magnesium transporter NIPA6
Arabidopsis	`AT2G21120` (AT2G21120) magnesium transporter, putative (DUF803) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816647] identity=71.6; qcov=0.854; evalue=6.52e-158; confidence=high
Rice	`Os01g0873700` - identity=68.6; qcov=0.983; evalue=8.59e-177; confidence=high
GO	GO:0015095 (magnesium ion transmembrane transporter activity); GO:0015693 (magnesium ion transport); GO:0016020 (membrane)
KEGG	-
Pfam	PF00892 (EamA); PF05653 (Mg_trans_NIPA)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006451

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole membrane	液泡膜	1.00000	`XP_057789593.1`
2	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057789593.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057789593.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057789593.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789593.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:39430265`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr1:39431087`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C13
`Chr1:39431212`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr1:39431717`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C31,C38,C49,C76
`Chr1:39431724`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C13
`Chr1:39431935`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B5
`Chr1:39431939`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr1:39432350`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B70,C2,C83,C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789593.1

350 aa

175

350

Mg_trans_NIPA

EamA

PF05653 Mg_trans_NIPA 4-295 aa PF00892 EamA 55-121 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789593.1`	Pfam	`PF05653`	Mg_trans_NIPA	Family	4	295	2e-131	438.3	Magnesium transporter NIPA
`XP_057789593.1`	Pfam	`PF00892`	EamA	Domain	55	121	5.5e-07	30.7	EamA-like transporter family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933610.1
CCTAGATCCCAAATACAAAAACCACCCAATCAAAAATCGTCTACTCAAAGTTGACCCTTTACACATACTCACACTCACACTCACAGATGAAGGAAACTCGAGCAATCTGTACGTATTCATACATGAAATCCTCCCCAAATTTACTGCCCTAGCATTTCTGCAGCTCGTTTTATTCGTGATCGGTGCATTTGTTTTCGGAAAATCAAGTCTGGGAGAGTAAAGAGCGCATCAAATGAGCATTAAATTTCGGAGGAATATAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006451
ATGTTTAAGGATAATCTAATTGGGTTTGGATTAGCTGTGGGATCGAGCGCGTTTATTGGATCCAGCTTCATCATCAAGAAGAAGGGTTTACTGAGAGCTGGCGCGTTGGGCTCTCGAGCTGGCTCTGGAGGATATGGATACTTGCTCGAACCACTTTGGTGGATTGGAATGTTTACGATGGTCATTGGGGAGTTTGCCAATTTTGTTGCTTATATGTATGCCCCCGCTGTCCTTGTTACACCACTTGGAGCATTAAGTAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789593.1
MFKDNLIGFGLAVGSSAFIGSSFIIKKKGLLRAGALGSRAGSGGYGYLLEPLWWIGMFTMVIGEFANFVAYMYAPAVLVTPLGALSIIVSAVLAHFLLKETLRKLGILGCVLCIVGSTVIVLHAPGEHAISSVEEIWELAVQPAFLLYVASAVAVVLALVLYCEPRYGQTNIMIYIGVCSVIGSLTVMSVKALGIAIKLTLEGSSQVAHFKSWVFAMVAATCVITQLNYLNKALDTFNTAVVSPIYYAMFTSLTIAASAI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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