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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002263`

染色体: Chr01 坐标: 39435058-39436642 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002263`
名称	SmilChr01G002263
描述	uncharacterized SmilChr01G002263
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	39435058 - 39436642 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014254`
GeneID	`131014254`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014254`
原始查询	`SmilChr01G002263`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0328500; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os02g0328500; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os02g0328500` - identity=27.8; qcov=0.492; evalue=1.06e-16; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014254

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057798151.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798151.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798151.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057798151.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057798151.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:39435189`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	89	A10,A16,A2,A22,A24,A25,A5,A6,B105,B107,B108,B11,B111,B118,B123,B124,B125,B126,B130,B131,B136,B138,B14,B17,B21,B24,B25,B26,B3,B33,B34,B39,B4,B44,B46,B50,B52,B56,B59,B60,B61,B62,B65,B67,B68,B69,B70,B72,B80,B90,B97,B98,C12,C14,C17,C18,C19,C23,C24,C30,C32,C36,C37,C38,C4,C45,C46,C49,C53,C56,C57,C59,C62,C63,C66,C68,C70,C72,C73,C74,C77,C8,C83,C85,C87,D2,D3,D4,D9
`Chr1:39435490`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B64,C9
`Chr1:39435514`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B105,B22,C64,C85
`Chr1:39435539`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B118,D6
`Chr1:39435539`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B118,D6
`Chr1:39435568`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr1:39435587`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A20,B76
`Chr1:39435626`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	20	A8,B10,B108,B110,B115,B12,B13,B64,B67,B71,B82,B90,B92,C23,C46,C47,C52,C74,C81,C86
`Chr1:39435628`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A22,B76,C49
`Chr1:39435634`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B44,C75,D3
`Chr1:39435662`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B107,B5,B62,B76,C60
`Chr1:39435664`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B54,C41,D9

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预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942168.1
TGCTGAGGGATTTTCGTTTCTCTGAAGCTTTGGAGCGAAAACTGGAAGCGCTGCTACAACGGAAGGGGAATCAATCAACAAGCGGAGAATATTCGGTACAATCATCCTTCATGACCATGAGTGAGACGCAGCAAGGCAGTAGCGATGTTTCTCGTGGGATGGCATCTAAGCCGGAGAAGACTCGCCGAAGCTGGACGAGTAGGGAGGAGGAGATGTTGTTGGCGTCACTGAAGGAACTAGTTGCTCAAGGATGGAAGGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014254
ATGACCATGAGTGAGACGCAGCAAGGCAGTAGCGATGTTTCTCGTGGGATGGCATCTAAGCCGGAGAAGACTCGCCGAAGCTGGACGAGTAGGGAGGAGGAGATGTTGTTGGCGTCACTGAAGGAACTAGTTGCTCAAGGATGGAAGGCTGACAATGGGTTTCGGGCGGGCTACCTTCTAAAGCTGGAGGAGGCGATGCGCAAGGAATTTATCGGGACTGACATCAAAGGAATGCCACATATCAATTCCAAAATAAGCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798151.1
MTMSETQQGSSDVSRGMASKPEKTRRSWTSREEEMLLASLKELVAQGWKADNGFRAGYLLKLEEAMRKEFIGTDIKGMPHINSKISAWKKSYNSLLTALDVSGVGFNAKGTFMLDCDNDQWEQILKNDRNASKMRFKSWPMLEGWKEVFGKDRANGTGAEDIMEAMHTMYQADNLAKGGDHLGQQGGDGFNHDVPEEETASVDGEDSVCFDAKKSASAKKTGKKCKASAGDEMNGVYAWLGEISRDTKERLENLSTRIGY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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