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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002265`

染色体: Chr01 坐标: 39444288-39446912 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002265`
名称	SmilChr01G002265
描述	uncharacterized SmilChr01G002265
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	39444288 - 39446912 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006423`
GeneID	`131006423`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006423`
原始查询	`SmilChr01G002265`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	elongation factor 1-delta, putative (DUF936) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817750]; symbol=AT2G31920; hit=AT2G31920; species=arabidopsis; confidence=low
产物	elongation factor 1-delta, putative (DUF936) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817750]; symbol=AT2G31920; hit=AT2G31920; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G31920` (AT2G31920) elongation factor 1-delta, putative (DUF936) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817750] identity=41; qcov=0.53; evalue=6.03e-14; confidence=low
Rice	`Os09g0516700` - identity=35.2; qcov=0.717; evalue=1.71e-12; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF06075 (CORD_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006423

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057789575.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057789575.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789575.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789575.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057789575.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:39445877`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr1:39445886`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A18
`Chr1:39445886`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A18
`Chr1:39445914`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr1:39446659`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B113,B120,C63,C70,C82
`Chr1:39446703`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C31,C36
`Chr1:39446709`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C24,C29,C32

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789575.1

198 aa

198

CORD_N

PF06075 CORD_N 2-42 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789575.1`	Pfam	`PF06075`	CORD_N	Domain	2	42	4.2e-11	43.5	CORD, N-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933592.1
CTCCTTCATTTTTTCAACACAACTTTCACTTCTATTTCTCAAAATTCCCAAATTTCCCCCTCCGATTCCCCATTTCCGGCGACTCCCGCTGCTTGCTCCCCTCCGGCGACTCGTCCACGCCGCCGTTTCCACCGCGCCCCTGCTCGCCCCGCCTCGCTCCGCCCCGCGCCGCTCCGCGCCCTGCGCTGCTGCCCGCCCCGCGCCTCGCCGCTGGTCGCCCCGCCTCGCGCCGCTGCCGCCCTGCGCCGCTGCTCGCCCCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006423
ATGGTCCAGCTGGGGCAGTTCATCTACGTGACTTGGCTCGATTACGGCTCCCCTGTCCCGGTGCTACGTGGCATCAAACCGAACACCAAGAGGCGGCCTTGTGTGGGTGATCCTAAGGATTTGATTTCTAGTGATTTCTTGAATGCCAAGAAAGTGGAAACTAGGACAAAATCCAAGGGGAAAGTCAAAAAAGTGGTAGGGAGCGAAGAGGGAAGTCTCAGAAGGCTCTCTTTTGGAAATGGCAAGGTTGGAGGAGGTAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789575.1
MVQLGQFIYVTWLDYGSPVPVLRGIKPNTKRRPCVGDPKDLISSDFLNAKKVETRTKSKGKVKKVVGSEEGSLRRLSFGNGKVGGGMESRRMSLDSARRGWNSSVQNKNGGKGSSKSKPKDTSSPSHSGPLVDPQRFMDVEQQLQDALVEIARQKEEMRQKDEQTDARFQAQQRMFEEILARLPPGPTGPTPPTGPSS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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