当前解析结果
SmilChr01G002270| 统一新 Gene ID | SmilChr01G002270 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G002270 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G002270 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 39471441 - 39473173 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131014920 |
|---|---|
| GeneID | 131014920 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131014920 |
| 原始查询 | SmilChr01G002270 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131014920 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057799078.1 |
| 2 | Mitochondrion | 线粒体 | 0.20000 | XP_057799078.1 |
| 3 | Cell membrane | 细胞膜 | 0.20000 | XP_057799078.1 |
| 4 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.20000 | XP_057799078.1 |
| 5 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057799078.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:39471624 |
C |
CAT |
2bp_insertion | frameshift_variant | 1 | B5 |
Chr1:39471624 |
C |
CAT |
2bp_insertion | CDS_variant | 1 | B5 |
Chr1:39471639 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C82,D11 |
Chr1:39471646 |
T |
TGC |
2bp_insertion | frameshift_variant | 1 | A15 |
Chr1:39471646 |
T |
TGC |
2bp_insertion | CDS_variant | 1 | A15 |
Chr1:39471651 |
A |
AGG |
2bp_insertion | frameshift_variant | 3 | A3,B113,C61 |
Chr1:39471651 |
A |
AGG |
2bp_insertion | CDS_variant | 3 | A3,B113,C61 |
Chr1:39471654 |
GCA |
G |
2bp_deletion | frameshift_variant | 3 | A3,B113,C61 |
Chr1:39471654 |
GCA |
G |
2bp_deletion | CDS_variant | 3 | A3,B113,C61 |
Chr1:39471667 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 3 | B22,B23,C39 |
Chr1:39471667 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B22,B23,C39 |
Chr1:39471676 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
3 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。