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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002272`

染色体: Chr01 坐标: 39488234-39489602 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002272`
名称	SmilChr01G002272
描述	uncharacterized SmilChr01G002272
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	39488234 - 39489602 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014931`
GeneID	`131014931`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014931`
原始查询	`SmilChr01G002272`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0693000; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os02g0693000; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`AT1G32690` (AT1G32690) DUF740 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840163] identity=29.6; qcov=1.11; evalue=2.21e-12; confidence=low
Rice	`Os02g0693000` - identity=67.5; qcov=0.206; evalue=2.9e-13; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05340 (DUF740)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014931

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057799098.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057799098.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799098.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799098.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057799098.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:39488858`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	42	A10,A15,A22,A24,B10,B105,B115,B119,B128,B134,B18,B21,B29,B30,B34,B51,B52,B54,B62,B66,B67,B68,B7,B87,B88,B97,C12,C15,C3,C31,C43,C45,C47,C48,C49,C5,C58,C60,C72,C83,D10,D7
`Chr1:39488931`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,B7,C45,C58
`Chr1:39489120`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B26,B63,B83,B95
`Chr1:39489124`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C40,C78
`Chr1:39489126`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B41,B88,C25
`Chr1:39489151`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C40,C78
`Chr1:39489163`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,C25
`Chr1:39489186`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B41,B94,C25
`Chr1:39489187`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B41,B94,C25
`Chr1:39489198`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,C25
`Chr1:39489204`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B113,C7
`Chr1:39489228`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B106

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799098.1

194 aa

194

DUF740

PF05340 DUF740 13-111 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799098.1`	Pfam	`PF05340`	DUF740	Family	13	111	0.0001	21.9	Protein of unknown function (DUF740)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943115.1
CAGAATTTACTAAATGAGAGTGGCCAAAAATCCTCACACGGCCTAATCCTATATATATACCACACAAATATGTCGTTACAGTTAGAAAGGGAAACATATACAAACACCACATTCACCTTAAATAAATAAATAAAAAACCAAAAAAAAAAAACCAATAATTCATTTCCTTCACAGATATTATTAATGGCGGCGGCTGCTGCGTATCGCGTGGAGGAGGAACAGCTCTGGAAATGCCCCAAGCACCCCTCCAAGCGGCGGCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014931
ATGGCGGCGGCTGCTGCGTATCGCGTGGAGGAGGAACAGCTCTGGAAATGCCCCAAGCACCCCTCCAAGCGGCGGCGTCACGGCGTCTGCCCCACCTGCCTCCGCGACCGCCTCATCAGCCTCTGCCCCAATTGCGGAAACGTCCGCCCCTGCCCCTGCAACGCCTCCGCCGCGCTCTCCTCCGCCTCCTCTTCCTCCTCCTCCTCCTGCACCGCCGCCGAGCCCTCCTTCGCCCGCTCCCGCTCTCTCGCCATCCCCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799098.1
MAAAAAYRVEEEQLWKCPKHPSKRRRHGVCPTCLRDRLISLCPNCGNVRPCPCNASAALSSASSSSSSSCTAAEPSFARSRSLAIPFFLRSNPSRVHTASFLSVFRRAKSKKGGDARKREGDGDGDGDEKHDVSNNRIEDFARMISRSRSVGVGTAARGCDGSPSSGKGKFWNLKAFRSSKTPKAADQSTSNKG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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