当前解析结果
SmilChr01G002276| 统一新 Gene ID | SmilChr01G002276 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G002276 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G002276 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 39526047 - 39527688 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131014957 |
|---|---|
| GeneID | 131014957 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131014957 |
| 原始查询 | SmilChr01G002276 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131014957 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057799122.1 |
| 2 | Nucleoplasm | 核质 | 0.40000 | XP_057799122.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057799122.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057799122.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057799122.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:39527041 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C13 |
Chr1:39527108 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B56,B69,C30 |
Chr1:39527158 |
C |
CTA |
2bp_insertion | frameshift_variant | 4 | B108,B16,C27,C60 |
Chr1:39527158 |
C |
CTA |
2bp_insertion | CDS_variant | 4 | B108,B16,C27,C60 |
Chr1:39527282 |
CAA |
C |
2bp_deletion | frameshift_variant | 32 | A25,B100,B108,B120,B123,B16,B17,B2,B21,B22,B24,B27,B30,B36,B4,B66,B68,B80,B81,B83,B98,C15,C23,C27,C28,C51,C53,C55,C60,C76,C87,D4 |
Chr1:39527292 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B2,B86,C20 |
Chr1:39527296 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B100,B108,B27,C23,D4 |
Chr1:39527311 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B89,B94,C39 |
Chr1:39527408 |
G |
GGT |
2bp_insertion | frameshift_variant | 14 | A15,A25,B101,B16,B17,B2,B40,C27,C28,C51,C54,C55,C60,D4 |
Chr1:39527415 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B101,B2,C54 |
Chr1:39527455 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C13 |
Chr1:39527464 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。