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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002284`

染色体: Chr01 坐标: 39631410-39633211 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002284`
名称	SmilChr01G002284
描述	mitogen-activated protein kinase kinase 10
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	39631410 - 39633211 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015025`
GeneID	`131015025`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015025`
原始查询	`SmilChr01G002284`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	mitogen-activated protein kinase kinase 10
产物	mitogen-activated protein kinase kinase 10
Arabidopsis	`AT1G32320` (MKK10) MAP kinase kinase 10 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840124] identity=45.2; qcov=0.867; evalue=6.27e-86; confidence=high
Rice	`Os02g0694900` (OsMKK10-1) - identity=44.3; qcov=0.854; evalue=7.49e-71; confidence=medium
GO	GO:0004674 (protein serine/threonine kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF03109 (ABC1); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr); PF14531 (Kinase-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015025

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057799206.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057799206.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057799206.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799206.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799206.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:39631711`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C13
`Chr1:39632073`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15
`Chr1:39632160`	`ACT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	A25
`Chr1:39632160`	`ACT`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	A25
`Chr1:39632306`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D9
`Chr1:39632306`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D9
`Chr1:39632811`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11
`Chr1:39632870`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:39633016`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr1:39633106`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,A8,B128,D3
`Chr1:39633131`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799206.1

383 aa

192

383

PK_Tyr_Ser-Thr

Pkinase

ABC1

Kinase-like

PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 75-354 aa PF00069 Pkinase 76-360 aa PF03109 ABC1 160-236 aa PF14531 Kinase-like 196-327 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799206.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	75	354	1.1e-27	97.7	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057799206.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	76	360	1e-54	186.4	Protein kinase domain
`XP_057799206.1`	Pfam	`PF03109`	ABC1	Domain	160	236	1.9e-08	34.5	ABC1 atypical kinase-like domain
`XP_057799206.1`	Pfam	`PF14531`	Kinase-like	Family	196	327	1.4e-06	28.5	Kinase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943223.1
CAAACAGACATACCTATTTCTTCTCCCAACCAAAACTCCATTTCCATCCCTCCCTCAAATCACTCTTCTCTTCTCTCTCTACAAACTCCACCCACAAAATGTGTATATATGCAGATACACACTGCAAGTCCTCTACCTACCTACTCATTTAGAGACTTGTTATACCCTAAAAAGTTCACACTAGTCTTACATATTTCTAATAAGTTTTTAATGAGAGAGCGAAGGCACCAACAAGTCCTACGCCTCACCTTGCCTCCACC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015025
ATGCAGATACACACTGCAAGTCCTCTACCTACCTACTCATTTAGAGACTTGTTATACCCTAAAAAGTTCACACTAGTCTTACATATTTCTAATAAGTTTTTAATGAGAGAGCGAAGGCACCAACAAGTCCTACGCCTCACCTTGCCTCCACCGGGCCTCTCTCTCAACCCGTCGCCGCTCTCATCCGCAAGCCGCTCCACCTCCCCCGGCATCTCGGAGCTCAAGAAGCTCTCCGTTCTCGGCCGTGGCAGCGGCGGCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799206.1
MQIHTASPLPTYSFRDLLYPKKFTLVLHISNKFLMRERRHQQVLRLTLPPPGLSLNPSPLSSASRSTSPGISELKKLSVLGRGSGGTVYKVSHKQTGAIYALKVVRGDQDDDDDLEAGAREAEILRRVDSSEHVVRYVGVFNGGLKEVEGGVGGGGGLCLVMEYMDAGSLHDILRRKKRLPEHIISGVVKSVLKGLQYLHGLGIVHGDVKPSNLLVNTRGQVKLADFGAAAAVRDGAKPRTRPDDRLEVHGRACRGTCPY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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