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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002287`

染色体: Chr01 坐标: 39670698-39674128 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002287`
名称	SmilChr01G002287
描述	4,5-DOPA dioxygenase extradiol
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	39670698 - 39674128 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015065`
GeneID	`131015065`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015065`
原始查询	`SmilChr01G002287`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	4,5-DOPA dioxygenase extradiol
产物	4%2C5-DOPA dioxygenase extradiol
Arabidopsis	`AT4G15093` (LigB) catalytic LigB subunit of aromatic ring-opening dioxygenase family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827174] identity=62.9; qcov=0.928; evalue=9.55e-113; confidence=high
Rice	`Os01g0878800` - identity=59.3; qcov=0.953; evalue=2.54e-115; confidence=high
GO	GO:0006725 (GO:0006725); GO:0008198 (ferrous iron binding); GO:0008270 (zinc ion binding); GO:0016701 (oxidoreductase activity, acting on single donors with incorporation of molecular oxygen)
KEGG	smil00965 (Betalain biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF02900 (LigB)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015065

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057799252.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057799252.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799252.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799252.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799252.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:39670880`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:39670946`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr1:39671015`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C40
`Chr1:39671075`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr1:39672305`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:39672493`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:39672580`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr1:39673478`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:39673541`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,B93
`Chr1:39673593`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B121,B13,B2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799252.1

276 aa

138

276

LigB

PF02900 LigB 16-272 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799252.1`	Pfam	`PF02900`	LigB	Domain	16	272	1.3e-52	179.3	Catalytic LigB subunit of aromatic ring-opening dioxygenase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943269.1
GATTGGAGGTGGACGATGCAAAAGACTGTCAGATTAAGTATTTAAAAGAAGAAAAACGTGACTCAAAATAATAAAATATTGCATGTATTGAAGTCGAATAATTGCTTGGTTACTAATACTAGTACTATTACACAAGCAAAGAAACAAGAGAGAAAAGCAGAGCATTTGTGGTAGATGATGGCGGCGTCGTTAAACATGGGGGGATTGAATTTGAAGGAGACGTTTTTCATCTCCCACGGCTCGCCGATGCTGTCGGTGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015065
ATGATGGCGGCGTCGTTAAACATGGGGGGATTGAATTTGAAGGAGACGTTTTTCATCTCCCACGGCTCGCCGATGCTGTCGGTGGACGACTCCATACCGGCGCGGCCCTTCCTCAAATCATTCCGGCAGAAATTGTTGACCGACAAGCCCGGATCCATTCTGCTGGTTTCCGCCCACTGGGAAACCACCCACCCCACCGTCAACGCCATCACCGGCCCTTCCGATACCATCTACGACTTCTACAACTTCCCCAAGCCCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799252.1
MMAASLNMGGLNLKETFFISHGSPMLSVDDSIPARPFLKSFRQKLLTDKPGSILLVSAHWETTHPTVNAITGPSDTIYDFYNFPKPLYQLKYPAPGAPELANKVKKLLEAGGFEHVVEDKERGLDHGAWVPLILMYPDADIPVCQLSVQTKMDATHHYNLGRALAPLKKEGVLIVGSGSATHNLRTLIDPSDSVASWAAEFNNWLKESLLAGRYEDVNQYLEKAPFAKQAHPRPEHLYPLHVAMGAAGVDAKAELIHDSW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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