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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002293`

染色体: Chr01 坐标: 39762061-39771829 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002293`
名称	SmilChr01G002293
描述	probable inactive shikimate kinase like 2, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	39762061 - 39771829 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015147`
GeneID	`131015147`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015147`
原始查询	`SmilChr01G002293`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable inactive shikimate kinase like 2, chloroplastic
产物	probable inactive shikimate kinase like 2%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT2G35500` (SKL2) shikimate kinase like 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818115] identity=66.8; qcov=0.988; evalue=3.66e-113; confidence=high
Rice	`Os10g0577700` - identity=58.9; qcov=0.976; evalue=5.14e-103; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04969 (CS)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015147

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057799395.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057799395.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057799403.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799395.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799395.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:39762478`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D2
`Chr1:39762584`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B121,B13,B2,D11
`Chr1:39762611`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B131,B33,B8,B93
`Chr1:39770132`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51
`Chr1:39770193`	`TCG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	D1
`Chr1:39770193`	`TCG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	D1
`Chr1:39770452`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr1:39770586`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C40
`Chr1:39771695`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B110
`Chr1:39771695`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B110

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799395.1

362 aa

181

362

PF04969 CS 60-137 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799395.1`	Pfam	`PF04969`	CS	Domain	60	137	1.9e-05	26.3	CS domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943412.1
GAGAGATATTGATGCATATATAGGGTGCAAGAAAACATCCATATTAGTATTATCTTGTTGTCAACAAGAATGGCCACAACACTTAGCTTCCACTCTCCAATTCTCTCTCGTCAGACTTGTCTCTCTACTCAAAATCTCTTGTCACTCCGAAGCCATTGTTTTCCTTTTTCTCGTGTTTCATTGCCCTCAATCTCATCCACAACTCCCTGTAGCATCAGCCCCATTATCTCCACAAATGCAACTCAGTATGAGTTTTGTGA...

XM_057943420.1
CTTGTCTCTCTACTCAAAATCTCTTGTCACTCCGAAGCCATTGTTTTCCTTTTTCTCGTGTTTCATTGCCCTCAATCTCATCCACAACTCCCTGTAGCATCAGCCCCATTATCTCCACAAATGCAACTCAGTATGAGGATAATTTTGAGTTATCTTTTGTTGCTGTTATTGCCTTCCAGAAGAATTGAAACTGATTTATAGGGTTAATGAAGAAGGAATAATACTGTATCTTGCCAGCATTCTTCCCCAATATTCAAGTG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131015147
ATGGCCACAACACTTAGCTTCCACTCTCCAATTCTCTCTCGTCAGACTTGTCTCTCTACTCAAAATCTCTTGTCACTCCGAAGCCATTGTTTTCCTTTTTCTCGTGTTTCATTGCCCTCAATCTCATCCACAACTCCCTGTAGCATCAGCCCCATTATCTCCACAAATGCAACTCAGTATGAGTTTTGTGATGATTCATCCGAGGTGGAGTTGAGATTGGAACTCGGGGAAGAAAGCAAAAGTCCGGGGGAAGTTTATGT...

LOC131015147
ATGTGGATGGAAGTGAGAACTCTTTGGTATATAGACGACACTCAACTGGTAGTTAACTTGAAAAAGCAAGATCCAGAACTAAAATGGCATGACATCGTGGAATCATGGGAGTCATTAACTACTGGAGTTGCCCAACTACTGAAAGGAACATCGATCTTCTTAGTTGGAGAATCAACAGAGATAAACAACAATATTGCTCGAGAATTAGCAGTCGGTCTTGGATACACTCCACTTAGCACCAAGGAGCTTCTTGAAGCGTG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057799395.1
MATTLSFHSPILSRQTCLSTQNLLSLRSHCFPFSRVSLPSISSTTPCSISPIISTNATQYEFCDDSSEVELRLELGEESKSPGEVYVDGSENSLVIKVQYSGFTKTLLDTNNLYGMIKPSETIWYIDDTQLVVNLKKQDPELKWHDIVESWESLTTGVAQLLKGTSIFLVGESTEINNNIARELAVGLGYTPLSTKELLEACSNQTIDSWKSEDRSDSITEAEAAILESLSSQARVVVATLGGKHGAARRPNKWQHLFAG...

XP_057799403.1
MWMEVRTLWYIDDTQLVVNLKKQDPELKWHDIVESWESLTTGVAQLLKGTSIFLVGESTEINNNIARELAVGLGYTPLSTKELLEACSNQTIDSWKSEDRSDSITEAEAAILESLSSQARVVVATLGGKHGAARRPNKWQHLFAGFTIWLSQSEATDEESAKEEVRNDIKDGERGYANAEVVVKVQGWDATYTKTVAQASLSALKRLVLSDKNITGRKSLYVRLGCRGDWPDIKAPAWDPSTTAPAS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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