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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002296`

染色体: Chr01 坐标: 39786026-39787044 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002296`
名称	SmilChr01G002296
描述	transcription factor MYB114-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	39786026 - 39787044 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015177`
GeneID	`131015177`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015177`
原始查询	`SmilChr01G002296`

查看完整 ID 对照表

已核对的文献基因名映射

这些条目来自人工核对的文献基因名与当前参考基因组的映射。置信度反映映射证据强度，不代表该功能已在本材料中完成实验验证。

文献基因名	映射置信度	映射证据	文献功能摘要
`SmMYB36`	high	BLASTN/BLASTX against website CDS/protein; 97.37% nucleotide identity, 100% query coverage	Regulates tanshinone and phenolic acid biosynthesis; affects metabolic flux.

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor MYB114-like
产物	transcription factor MYB114-like
Arabidopsis	`AT5G40330` (MYB23) myb domain protein 23 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834031] identity=57.8; qcov=0.744; evalue=1.45e-44; confidence=medium
Rice	`Os09g0538400` (R2R3-MYB) - identity=57.4; qcov=0.692; evalue=9.36e-41; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00249 (Myb_DNA-binding); PF13921 (Myb_DNA-bind_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015177

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057799436.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799436.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799436.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057799436.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057799436.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:39786175`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C40
`Chr1:39786221`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B131,B33,B8,B93
`Chr1:39786619`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:39786649`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B83,C3
`Chr1:39786705`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B33,B8
`Chr1:39786705`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,B8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799436.1

164 aa

164

Myb_DNA-binding

Myb_DNA-bind_6

Myb_DNA-binding

Myb_DNA-bind_6

PF00249 Myb_DNA-binding 9-56 aa PF13921 Myb_DNA-bind_6 12-71 aa PF00249 Myb_DNA-binding 62-107 aa PF13921 Myb_DNA-bind_6 65-110 aa

XP_057799442.1

156 aa

156

Myb_DNA-binding

Myb_DNA-bind_6

Myb_DNA-binding

PF00249 Myb_DNA-binding 9-56 aa PF13921 Myb_DNA-bind_6 12-71 aa PF00249 Myb_DNA-binding 75-99 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799436.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	9	56	4.6e-36	123.4	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057799436.1`	Pfam	`PF13921`	Myb_DNA-bind_6	Domain	12	71	1.2e-22	80.6	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057799436.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	62	107	4.6e-36	123.4	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057799436.1`	Pfam	`PF13921`	Myb_DNA-bind_6	Domain	65	110	1.2e-22	80.6	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057799442.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	9	56	1.9e-27	95.9	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057799442.1`	Pfam	`PF13921`	Myb_DNA-bind_6	Domain	12	71	1.7e-18	67.2	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057799442.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	75	99	1.9e-27	95.9	Myb-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943453.1
GGGCGAGGATGATGCGGTAGCTGAAATGCACGACTAACCTGGCAGCTGCATAATTTTGCCAACCCCCAATCCCAATCCCAATCCCATACATATATATGGTTGAAAAAAACATAAAAATGAATAGAGATGGCGAGTGATGCATCTCTGAACAAAGGGGCGTGGAGTGTGGATGAAGATACGACTCTGGCCCAATACGTCGCCCTTCACGGCCCCAAGAGGTGGAAATCTGTGGCCATCAAATCAGGCCTCAACAGGTGCGG...

XM_057943459.1
GGGCGAGGATGATGCGGTAGCTGAAATGCACGACTAACCTGGCAGCTGCATAATTTTGCCAACCCCCAATCCCAATCCCAATCCCATACATATATATGGTTGAAAAAAACATAAAAATGAATAGAGATGGCGAGTGATGCATCTCTGAACAAAGGGGCGTGGAGTGTGGATGAAGATACGACTCTGGCCCAATACGTCGCCCTTCACGGCCCCAAGAGGTGGAAATCTGTGGCCATCAAATCAGGCCTCAACAGGTGCGG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131015177
ATGGCGAGTGATGCATCTCTGAACAAAGGGGCGTGGAGTGTGGATGAAGATACGACTCTGGCCCAATACGTCGCCCTTCACGGCCCCAAGAGGTGGAAATCTGTGGCCATCAAATCAGGCCTCAACAGGTGCGGTAAGAGTTGCAGGTTGAGATGGCTCAACTATCTTAGACCTGATATCAAAAGAGGCAACTTCTCCGATGCTGAAGAGGACTTGATTCTTAGGTTACATAGGCTCCTAGGAAATAAGTGGTCGTTGAT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057799436.1
MASDASLNKGAWSVDEDTTLAQYVALHGPKRWKSVAIKSGLNRCGKSCRLRWLNYLRPDIKRGNFSDAEEDLILRLHRLLGNKWSLIAKRIPGRTDNEIKNYWNAHLRKKAMLMDKLPAISTAAMKQNNIWNETDETGGDDESLDVSASGLDWVKSFLELDEDE

XP_057799442.1
MASDASLNKGAWSVDEDTTLAQYVALHGPKRWKSVAIKSGLNRCGKSCRLRWLNYLRPDIKRGNFSDAEEDLILRWSLIAKRIPGRTDNEIKNYWNAHLRKKAMLMDKLPAISTAAMKQNNIWNETDETGGDDESLDVSASGLDWVKSFLELDEDE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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