当前解析结果
SmilChr01G002316| 统一新 Gene ID | SmilChr01G002316 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G002316 |
| 描述 | nudix hydrolase 8-like |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 40144918 - 40148990 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131015334 |
|---|---|
| GeneID | 131015334 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131015334 |
| 原始查询 | SmilChr01G002316 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | nudix hydrolase 8-like |
| 产物 | nudix hydrolase 8-like |
| Arabidopsis | AT5G47240 (NUDT8)nudix hydrolase homolog 8 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834771] identity=56.9; qcov=0.994; evalue=1.85e-144; confidence=high |
| Rice | Os04g0547900- identity=64.8; qcov=0.756; evalue=1.15e-131; confidence=high |
| GO | GO:0035529 (NADH pyrophosphatase activity); GO:0047631 (ADP-ribose diphosphatase activity); GO:0051287 (NAD binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00293 (NUDIX); PF18290 (Nudix_hydro) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131015334 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Chloroplast | 叶绿体 | 1.00000 | XP_057799682.1 |
| 2 | Chloroplast stroma | 叶绿体基质 | 0.20000 | XP_057799682.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057799682.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057799682.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057799682.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057799682.1PF18290
Nudix_hydro 93-171 aa
PF00293
NUDIX 184-300 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057799682.1 |
Pfam | PF18290 |
Nudix_hydro | Domain | 93 | 171 | 1.1e-30 | 106.1 | Nudix hydrolase domain |
XP_057799682.1 |
Pfam | PF00293 |
NUDIX | Domain | 184 | 300 | 3.2e-20 | 73.2 | NUDIX domain |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。