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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002321`

染色体: Chr01 坐标: 40281402-40282766 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002321`
名称	SmilChr01G002321
描述	uncharacterized SmilChr01G002321
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	40281402 - 40282766 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008095`
GeneID	`131008095`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008095`
原始查询	`SmilChr01G002321`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cotton fiber protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825209]; symbol=AT3G60380; hit=AT3G60380; species=arabidopsis; confidence=low
产物	cotton fiber protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825209]; symbol=AT3G60380; hit=AT3G60380; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G60380` (AT3G60380) cotton fiber protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825209] identity=30.2; qcov=0.496; evalue=1.47e-18; confidence=low
Rice	`Os10g0562000` (OSJNBb0089A17.6) - identity=31.8; qcov=0.491; evalue=1.3e-16; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05553 (DUF761)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008095

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057790980.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057790980.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790980.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790980.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057790980.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:40281704`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B86,C87
`Chr1:40281842`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,A9,B61,B65,C42
`Chr1:40281919`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:40281922`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B60,C25
`Chr1:40281997`	`GGC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C2
`Chr1:40281997`	`GGC`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C2
`Chr1:40282163`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B58,C27,C37
`Chr1:40282343`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B69,C18
`Chr1:40282550`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B56,B96
`Chr1:40282673`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B118,B124,B131,C74,C75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790980.1

454 aa

227

454

DUF761

PF05553 DUF761 416-446 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790980.1`	Pfam	`PF05553`	DUF761	Family	416	446	1.4e-13	50.9	Cotton fibre expressed protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934997.1
ATGGCAGATGCAGCTCCCAAAACCCAAATCAAATCACCCTCTGATCATGAAAATCCAAGTAAGTTTTTTCTGTACAAGGCTGCCCTTGTTACAGTTTTCCTAGTCTTGGTCCCACTTTTCCCCTCTTTGGCTCCTGATTTCTTCAACCAAACCTTGCACGCGAGAAGCTGGGAGCTTCTGCAGCTCATTTTTGTGGGCATAGCCGTTTCTTATGGGCTGTTTAGCAAGAAAAATGATGAGCCACACAAAGATTATAAGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008095
ATGGCAGATGCAGCTCCCAAAACCCAAATCAAATCACCCTCTGATCATGAAAATCCAAGTAAGTTTTTTCTGTACAAGGCTGCCCTTGTTACAGTTTTCCTAGTCTTGGTCCCACTTTTCCCCTCTTTGGCTCCTGATTTCTTCAACCAAACCTTGCACGCGAGAAGCTGGGAGCTTCTGCAGCTCATTTTTGTGGGCATAGCCGTTTCTTATGGGCTGTTTAGCAAGAAAAATGATGAGCCACACAAAGATTATAAGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790980.1
MADAAPKTQIKSPSDHENPSKFFLYKAALVTVFLVLVPLFPSLAPDFFNQTLHARSWELLQLIFVGIAVSYGLFSKKNDEPHKDYKIDNAQSYVSKLLQVSSVFDDESENHTVIEESKFQALNSQYYRGEPPLVVVAKENSAVDKENGVVSQISQKPLLLPVRSLKQRVPSPNSRKSRIGDFGRLNVDKVAAEKEEAAEEKVVLRSPIPWRSRSGRMEIKETGDELASPSTEEQELNRSESRSFRSFRATNPNASSPKKL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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