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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002344`

染色体: Chr01 坐标: 40586139-40589976 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002344`
名称	SmilChr01G002344
描述	putative glycerol-3-phosphate transporter 4
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	40586139 - 40589976 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024571`
GeneID	`131024571`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024571`
原始查询	`SmilChr01G002344`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative glycerol-3-phosphate transporter 4
产物	putative glycerol-3-phosphate transporter 4
Arabidopsis	`AT4G17550` (G3Pp4) Major facilitator superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827470] identity=73.1; qcov=0.995; evalue=9.23e-88; confidence=high
Rice	`Os04g0555300` (FCO11) - identity=68.8; qcov=0.925; evalue=2.35e-75; confidence=high
GO	GO:0022857 (transmembrane transporter activity); GO:0055062 (phosphate ion homeostasis); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF07690 (MFS_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024571

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.60000	`XP_057810075.1`
2	Lysosome	溶酶体	0.60000	`XP_057810075.1`
3	Lysosome membrane	溶酶体膜	0.60000	`XP_057810075.1`
4	Secretory vesicle	Secretory vesicle	0.40000	`XP_057810075.1`
5	Vesicle	囊泡	0.40000	`XP_057810075.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:40586547`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B44,B85,C14,C55
`Chr1:40586570`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,A3,C3
`Chr1:40586577`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,A3,C3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810075.1

187 aa

187

MFS_1

PF07690 MFS_1 2-154 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810075.1`	Pfam	`PF07690`	MFS_1	Family	2	154	5.1e-15	56.0	Major Facilitator Superfamily

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954092.1
CGAAAATTATGAATTCCATGTTGAGGTCTATTGTAGAAATTAAGGAAGAGGTTTTTAGTGTTTTGCTCCCCCTCACGTGCATATAATTTTCCATTGATATTCAGCTTTTCCACATTCTATTTCAACTTCTTTCGTGCATGCTCTACCTTCTATTCCTTAGCACAGATGGCATATGCTAGGAGTTTTTTTTTTTGTTTTCAAGCATGCTATACTGATTGATCTTTGGGAATGTTTCCTTCATAATATACCTTCCTTTTCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024571
ATGTCAGTGAAGTCTGCAGGAAATCTTTCTACTTTATTTGATGTCGGAGGAATAATTGGTGGAATTTTAGCTGGTTATATATCCGACAAGCTTAGAGCTCGGGCTACTACTGCTGCTAGCTTCATGTACACTGCAATACCTGCTATGCTTCTTTACCGTAGATATGGAAGTATTTCAAAAGCCAGCAACGTTGCTCTTATGATGATAGCTGGTTTACTTGTAAATGGACCTTATGCACTTATTACAACTGCAGTCTCTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810075.1
MSVKSAGNLSTLFDVGGIIGGILAGYISDKLRARATTAASFMYTAIPAMLLYRRYGSISKASNVALMMIAGLLVNGPYALITTAVSADLGTHSSLKGDSRALATVTAIIDGTGSIGAALGPLLTGFLSSQSWDAVFYMLILGAFAAGLLLTHLVIAEIKEKFSRQLSSEQNDNSGEASRPLLSDQRR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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