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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002348`

染色体: Chr01 坐标: 40627409-40632379 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002348`
名称	SmilChr01G002348
描述	50S ribosomal protein L19-2, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	40627409 - 40632379 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024625`
GeneID	`131024625`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024625`
原始查询	`SmilChr01G002348`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	50S ribosomal protein L19-2, chloroplastic-like
产物	50S ribosomal protein L19-2%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT5G47190` (AT5G47190) Ribosomal protein L19 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834765] identity=60.6; qcov=0.882; evalue=6.1e-79; confidence=high
Rice	`Os02g0652600` - identity=65.5; qcov=0.443; evalue=4.02e-51; confidence=low
GO	GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01245 (Ribosomal_L19)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024625

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057810114.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.40000	`XP_057810114.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057810114.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810114.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810114.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:40627472`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	61	A10,A24,A25,A7,B100,B101,B106,B110,B115,B119,B12,B121,B122,B123,B132,B134,B17,B21,B23,B30,B32,B33,B40,B5,B52,B53,B60,B62,B71,B8,B81,B83,B87,B88,B89,B90,B92,B93,C11,C12,C16,C18,C3,C30,C39,C4,C40,C53,C54,C58,C59,C62,C69,C71,C78,C80,C86,D11,D3,D4,D8
`Chr1:40627540`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A1,B130,C29
`Chr1:40627576`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	19	A14,B10,B12,B121,B129,B13,B133,B136,B2,B33,B58,B69,B95,C13,C27,C47,D10,D2,D5
`Chr1:40627835`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr1:40627850`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B32,C11,C69
`Chr1:40627938`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B47,B78,C26
`Chr1:40629946`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B32,C11,C69
`Chr1:40629958`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr1:40632080`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A20,B18

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810114.1

262 aa

131

262

Ribosomal_L19

PF01245 Ribosomal_L19 160-257 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810114.1`	Pfam	`PF01245`	Ribosomal_L19	Family	160	257	1.5e-30	106.1	Ribosomal protein L19

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954131.1
ACCGACCTATATCGTATTAAAGAAATTTAATATGATGATTTTTATCTTGCTTAGAACTTGTCTATGACTTTGGAGCATTCAGTAAAATTTCAATCAAAATACAACGGACGGATAAGGCTGCACTGCGCACACACTTCACTCTATTTTGCTTCAGCTTCCACTAATATCATATCTGAATCTCCAGTTATGTCCTCCAACTTTCTTCCTCAGACGTTGTTCGTGGTCCCTAGATGCTCGGCGCAATGCCAGCCAAAGAGCCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024625
ATGACTTTGGAGCATTCAGTAAAATTTCAATCAAAATACAACGGACGGATAAGGCTGCACTGCGCACACACTTCACTCTATTTTGCTTCAGCTTCCACTAATATCATATCTGAATCTCCAGTTATGTCCTCCAACTTTCTTCCTCAGACGTTGTTCGTGGTCCCTAGATGCTCGGCGCAATGCCAGCCAAAGAGCCTGGCGCTTTCAGCTGCCCCTTCGCGGCGCCCCTCCGCCGGAGGGTTGGCTTCTAGGATTTCAAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810114.1
MTLEHSVKFQSKYNGRIRLHCAHTSLYFASASTNIISESPVMSSNFLPQTLFVVPRCSAQCQPKSLALSAAPSRRPSAGGLASRISTRPFGFNFAEKDRKLSFLVRAETNPEAEAVVEESQDNADSVDSEEAEVLPDDKPPSKPRIKLGDIMGILNKKAIEASDGVRPTPDLRTGDIVEIKLEVPENRRRLSIYKGIVISKQNAGIHTTIRIRRVIAGVGVEIVFPVYSPNIKEIKVIKHRKVRRARLYYLRDKLPRLST...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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