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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002357`

染色体: Chr01 坐标: 40743682-40755087 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002357`
名称	SmilChr01G002357
描述	uncharacterized SmilChr01G002357
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	40743682 - 40755087 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024720`
GeneID	`131024720`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024720`
原始查询	`SmilChr01G002357`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Man1-Src1p-carboxy-terminal domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834699]; symbol=AT5G46560; hit=AT5G46560; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Man1-Src1p-carboxy-terminal domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834699]; symbol=AT5G46560; hit=AT5G46560; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G46560` (AT5G46560) Man1-Src1p-carboxy-terminal domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834699] identity=45.5; qcov=0.956; evalue=5.11e-106; confidence=high
Rice	`Os03g0100050` - identity=49; qcov=0.275; evalue=3.34e-17; confidence=weak
GO	GO:0003682 (chromatin binding); GO:0005637 (nuclear inner membrane)
KEGG	-
Pfam	PF09402 (MSC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024720

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.60000	`XP_057810244.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.60000	`XP_057810244.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057810244.1`
4	Nucleus membrane	核膜	0.20000	`XP_057810244.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810244.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:40747817`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:40749953`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23
`Chr1:40749960`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B128,B82,C34,C75,D9
`Chr1:40752450`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C14,C74
`Chr1:40752634`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B11,C11,C69
`Chr1:40754811`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B56,B96,C23
`Chr1:40754841`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:40754846`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr1:40754862`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B128,B82,C34,C75,D9
`Chr1:40754870`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B66,C61,D7
`Chr1:40754935`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B11,C11,C69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810244.1

369 aa

184

369

MSC

PF09402 MSC 67-327 aa

XP_057810249.1

369 aa

184

369

MSC

PF09402 MSC 67-327 aa

XP_057810255.1

363 aa

182

363

MSC

PF09402 MSC 68-327 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810244.1`	Pfam	`PF09402`	MSC	Domain	67	327	4e-16	60.1	Man1-Src1p-C-terminal domain
`XP_057810249.1`	Pfam	`PF09402`	MSC	Domain	67	327	4e-16	60.1	Man1-Src1p-C-terminal domain
`XP_057810255.1`	Pfam	`PF09402`	MSC	Domain	68	327	3.4e-16	60.3	Man1-Src1p-C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XR_009101984.1
GGACATAATAGTGTAGAGTAGTGACTAGTGTCTAGTGATATCAAAGAGTGCATCTGAGCTGCTAAAGCTGTTTGAAGTTGGCGCCCTTATGAGGGAATTTCTTCATTCTCCCAATCACCATGAAGAAAAAAAGGCCTAAACCCTCCTCCTACCGCACTCTGTTTCCGCCGGAGCCATCCTTAAATTCTCTGCCCTCATCCAAGGCCGACTTTTCCCGGTTGATCGCCGTCGTTTCCATCGCCGCCGCGGTGGCGCTTGCC...

XM_057954272.1
ATAATAGTGTAGAGTAGTGACTAGTGTCTAGTGATATCAAAGAGTGCATCTGAGCTGCTAAAGCTGTTTGAAGTTGGCGCCCTTATGAGGGAATTTCTTCATTCTCCCAATCACCATGAAGAAAAAAAGGCCTAAACCCTCCTCCTACCGCACTCTGTTTCCGCCGGAGCCATCCTTAAATTCTCTGCCCTCATCCAAGGCCGACTTTTCCCGGTTGATCGCCGTCGTTTCCATCGCCGCCGCGGTGGCGCTTGCCTGCA...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131024720
ATGAAGAAAAAAAGGCCTAAACCCTCCTCCTACCGCACTCTGTTTCCGCCGGAGCCATCCTTAAATTCTCTGCCCTCATCCAAGGCCGACTTTTCCCGGTTGATCGCCGTCGTTTCCATCGCCGCCGCGGTGGCGCTTGCCTGCAATTTCATTACCGCTTCCCTTAATCAGCCGCCTAAGCCCTTCTGCGATACTACTGATGACCTCAATGATCCCCTCTCTGAATACTGCCAACCATGTCCCACAAATGGAGTATGTTA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057810244.1
MKKKRPKPSSYRTLFPPEPSLNSLPSSKADFSRLIAVVSIAAAVALACNFITASLNQPPKPFCDTTDDLNDPLSEYCQPCPTNGVCYDGKLTCDQGFRKQGNLCVEDGDISRAAKKLSQWVEDRVCGAYAQLLCSGTGKCWIEVDELLDNLDRMSDNRNLDKAIYMPTKQKAMETIRSALETRRDNQGVEELKCPELLVDNYKPLSCVVRQWIIKHALLLVPACALIVGCILIACRAYQRHLLSVRAEQLYHEVCDILEE...

XP_057810249.1
MKKKRPKPSSYRTLFPPEPSLNSLPSSKADFSRLIAVVSIAAAVALACNFITASLNQPPKPFCDTTDDLNDPLSEYCQPCPTNGVCYDGKLTCDQGFRKQGNLCVEDGDISRAAKKLSQWVEDRVCGAYAQLLCSGTGKCWIEVDELLDNLDRMSDNRNLDKAIYMPTKQKAMETIRSALETRRDNQGVEELKCPELLVDNYKPLSCVVRQWIIKHALLLVPACALIVGCILIACRAYQRHLLSVRAEQLYHEVCDILEE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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