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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002360`

染色体: Chr01 坐标: 40764308-40770359 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002360`
名称	SmilChr01G002360
描述	uncharacterized SmilChr01G002360
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	40764308 - 40770359 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024763`
GeneID	`131024763`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024763`
原始查询	`SmilChr01G002360`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ubiquitin family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818103]; symbol=AT2G35360; hit=AT2G35360; species=arabidopsis; confidence=high
产物	ubiquitin family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818103]; symbol=AT2G35360; hit=AT2G35360; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G35360` (AT2G35360) ubiquitin family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818103] identity=54.8; qcov=0.95; evalue=6.64e-78; confidence=high
Rice	`Os09g0573100` - identity=51.8; qcov=0.986; evalue=5.83e-73; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF10260 (SAYSvFN)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024763

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057810292.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057810292.1`
3	Nucleus membrane	核膜	0.40000	`XP_057810292.1`
4	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057810292.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810292.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:40767367`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B128,B82,C34,C75,D9
`Chr1:40767645`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr1:40767691`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9
`Chr1:40767698`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	11	B112,B126,B21,B36,B77,B94,C30,C6,C63,C67,D9
`Chr1:40768838`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,B35,B76
`Chr1:40769820`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A3
`Chr1:40769837`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810292.1

221 aa

110

221

SAYSvFN

PF10260 SAYSvFN 150-216 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810292.1`	Pfam	`PF10260`	SAYSvFN	Domain	150	216	1.2e-25	89.9	Uncharacterized conserved domain (SAYSvFN)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009101986.1
CGTCAATCTAGCTACTCAACGGTGGAAGATGTATCTCAAGTGCACATGGAAATTTCTCAAGATCCAATGGTTGGGGTGTATCACATTCTATCTCCTACTTTATCACTTTATTACCTTTTATTTCCTACATACTTAAAACACTCATCTACAACTCTTTAAATTCCGTGCTCAAAAGAAACGCACCACTTTGCGCGAGAGGAAGGGAGTAACTTTTTTCTACAATTAATACACTCAATAATTTTTTTCTTAAAATTATATAC...

XM_057954309.1
TAACGGGAATTGGGAAGTTGGATAATTCCTTTGAAATTTACTGGTGGCTGTCTGATCAAAAGGCCTCTCCAAAATTCTCCCCAGTTCGAAGGCCAAGGCCAAATCGAATAATACCACCAACTCCTGATTGTAGCATCTGTCTGATTTGTAGCATTGAGGTACAACAATTGATTGCAGTAATGGCGGATCTCATCGAAGAAGATGAAAAAATGGTTGACATCACTCTGCGAACCATCGGCCCTTCACCTCGCTCCCGCCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024763
ATGGCGGATCTCATCGAAGAAGATGAAAAAATGGTTGACATCACTCTGCGAACCATCGGCCCTTCACCTCGCTCCCGCCTCACCCTCCCCTCTACGCTCAAAGTTAAAGAGTTGAGGAAACTGATTTCTGGAACTACTCACTTGCCCCTGGAGAATATGACACTTGTTTTCCGCGGAAATGTGTTGCATGATAGTACAAATGGTGAAGACTCATTGGTCCAACTCCACGAGCGAGAAACTGTGACTGTTGCTATCAAACC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810292.1
MADLIEEDEKMVDITLRTIGPSPRSRLTLPSTLKVKELRKLISGTTHLPLENMTLVFRGNVLHDSTNGEDSLVQLHERETVTVAIKPKPPAKHIQDSFDEDDGEDLKFQLPESTSRWKRRLFFTLRDKFKLPDMLLMAIFSLRTKTWAAILIWFILAPVAHRLGIGPLYILATGFFIIFYNLGHRQPGDVSAYSIFNEDFRELPGTLNADRLDRDIRLGQF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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