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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002362`

染色体: Chr01 坐标: 40777094-40780756 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002362`
名称	SmilChr01G002362
描述	uncharacterized SmilChr01G002362
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	40777094 - 40780756 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024783`
GeneID	`131024783`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024783`
原始查询	`SmilChr01G002362`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RPA1A; symbol=RPA1A; hit=Os02g0776800; species=rice; confidence=low
产物	RPA1A; symbol=RPA1A; hit=Os02g0776800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G45400` (RPA70C) Replication factor-A protein 1-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834576] identity=28.1; qcov=0.567; evalue=6.68e-08; confidence=low
Rice	`Os02g0776800` (RPA1A) - identity=28.1; qcov=0.678; evalue=1.44e-08; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF08646 (Rep_fac-A_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024783

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057810305.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810305.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810305.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057810305.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057810305.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:40777314`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:40777366`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,A14,B21,C64
`Chr1:40777387`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B128,C34,C75
`Chr1:40777402`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B47,C51,C74
`Chr1:40777438`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9
`Chr1:40778908`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,B91
`Chr1:40778921`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,D10
`Chr1:40778943`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86
`Chr1:40779120`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	A21,B40,B53,B99,C74
`Chr1:40779120`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B40,B53,B99,C74
`Chr1:40779144`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B99
`Chr1:40779144`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810305.1

326 aa

163

326

Rep_fac-A_C

PF08646 Rep_fac-A_C 103-221 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810305.1`	Pfam	`PF08646`	Rep_fac-A_C	Domain	103	221	2.8e-16	60.3	Replication factor-A C terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954322.1
CGCAAGTAACCTGTGTCTTATGGGGATCACTTGTCGAGGAATTGAAAACATTTATGGAGAACAAATCAGCAGAAGACAAAGAGCCTGTAATGGTGGCATTGCAATTTGCAAAGATATCCACATTCAGAGGCCAAATCAAGGTTTCCTCGATGAAGAATGCGAGCAAATTTTTTATCTGTCCAGATATAAAAGAAGTGAAAGATTTTATACTAAGGCGTGGTGTTAGTAGATCTTCTAGCTGTAATGATACCATTACCGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024783
ATGGAGAACAAATCAGCAGAAGACAAAGAGCCTGTAATGGTGGCATTGCAATTTGCAAAGATATCCACATTCAGAGGCCAAATCAAGGTTTCCTCGATGAAGAATGCGAGCAAATTTTTTATCTGTCCAGATATAAAAGAAGTGAAAGATTTTATACTAAGGCGTGGTGTTAGTAGATCTTCTAGCTGTAATGATACCATTACCGATATATCTATCGGTCAACAAGCACTGAATAGGAATGAATGGTTGGATGCTGCTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810305.1
MENKSAEDKEPVMVALQFAKISTFRGQIKVSSMKNASKFFICPDIKEVKDFILRRGVSRSSSCNDTITDISIGQQALNRNEWLDAAHARRLCDLIKSEECGTFNCKGTILDFHPQESWYYEACGNDRCLKGIAKGSTIGDHCKKCKRPIGSIIIRYLMKVLVGDEIDQTYFTIFEDYALYLLKRTATQVMEEMVQQTGDRNGTPEMLSTMLVRECLFKVEVGLRFGERVYTVKNVTGDARVIAQFPSGVNVGLQEVASKY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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