当前解析结果
SmilChr01G002367| 统一新 Gene ID | SmilChr01G002367 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G002367 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G002367 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 40843595 - 40850842 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131024825 |
|---|---|
| GeneID | 131024825 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131024825 |
| 原始查询 | SmilChr01G002367 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | Tryptophan RNA-binding attenuator protein-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834789]; symbol=AT5G47420; hit=AT5G47420; species=arabidopsis; confidence=high |
| 产物 | Tryptophan RNA-binding attenuator protein-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834789]; symbol=AT5G47420; hit=AT5G47420; species=arabidopsis; confidence=high |
| Arabidopsis | AT5G47420 (AT5G47420)Tryptophan RNA-binding attenuator protein-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834789] identity=74.1; qcov=1; evalue=6.43e-161; confidence=high |
| Rice | Os03g0747300 (OJ1124_H03.5)- identity=62.4; qcov=1; evalue=1.98e-132; confidence=high |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF01987 (AIM24) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131024825 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.40000 | XP_057810350.1 |
| 2 | Golgi apparatus | 高尔基体 | 0.40000 | XP_057810350.1 |
| 3 | Nucleus membrane | 核膜 | 0.20000 | XP_057810350.1 |
| 4 | Endoplasmic reticulum membrane | 内质网膜 | 0.20000 | XP_057810350.1 |
| 5 | Endosome membrane | 内体膜 | 0.20000 | XP_057810350.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:40847595 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | C41 |
Chr1:40847595 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C41 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057810350.1PF01987
AIM24 25-233 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057810350.1 |
Pfam | PF01987 |
AIM24 | Family | 25 | 233 | 8.6e-49 | 166.7 | Mitochondrial biogenesis AIM24 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。