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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002375`

染色体: Chr01 坐标: 40963375-40970669 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002375`
名称	SmilChr01G002375
描述	uncharacterized SmilChr01G002375
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	40963375 - 40970669 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024871`
GeneID	`131024871`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024871`
原始查询	`SmilChr01G002375`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	OsRH41; symbol=OsRH41; hit=Os02g0201900; species=rice; confidence=weak
产物	OsRH41; symbol=OsRH41; hit=Os02g0201900; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`AT3G02065` (AT3G02065) P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821155] identity=56.9; qcov=0.118; evalue=2.14e-12; confidence=weak
Rice	`Os02g0201900` (OsRH41) - identity=45.7; qcov=0.187; evalue=1.05e-12; confidence=weak
GO	GO:0000812 (Swr1 complex); GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0006338 (chromatin remodeling); GO:0008270 (zinc ion binding); GO:0031491 (nucleosome binding)
KEGG	-
Pfam	PF04438 (zf-HIT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024871

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057810406.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057810417.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057810406.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810417.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810417.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:40964032`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:40965856`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,B15,C76
`Chr1:40965857`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B5,C71,D9
`Chr1:40965926`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C55
`Chr1:40966727`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B100,B12,B46,C37
`Chr1:40966781`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B100,B12,B46,C37
`Chr1:40966803`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr1:40967121`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C33
`Chr1:40967148`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B130,B140,C35
`Chr1:40968150`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B100,B12,B46,C37
`Chr1:40968151`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr1:40969500`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A13,B35,C14,C74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810406.1

455 aa

228

455

zf-HIT

PF04438 zf-HIT 169-196 aa

XP_057810412.1

455 aa

228

455

zf-HIT

PF04438 zf-HIT 169-196 aa

XP_057810417.1

433 aa

216

433

zf-HIT

PF04438 zf-HIT 147-174 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810406.1`	Pfam	`PF04438`	zf-HIT	Domain	169	196	1.9e-06	28.2	HIT zinc finger
`XP_057810412.1`	Pfam	`PF04438`	zf-HIT	Domain	169	196	1.9e-06	28.2	HIT zinc finger
`XP_057810417.1`	Pfam	`PF04438`	zf-HIT	Domain	147	174	1.8e-06	28.3	HIT zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XR_009102019.1
GATTTTACACGTAAACATAGATGCTCATAATATTTCCAAAAGGAGGGCATATGATTATGTACCTTTTCCCTATTTTAAATTCTGTTTACAGGAAAAAACCGATTGCAGTGTGAAGTTATAGAAAAGGATCAATGGGGACTCGGTCGAATTTCTATAAGAATCCCTCTTATGCGTACAACAAGAAATTAAACCTCAATTCCGTCCTTCAAAATCTCAATTCTTACAATATTGTCACCGGAAATGCTCCTGCGGAAGAACCA...

XM_057954429.1
AACTGCTCCTCCTTGGCGGCGGCTTCCTCGTCGAGACGGACTTTCTCCCGGTTATCGAAGTTGTAGACATTCCACTTCTTCTGCGGGAGGATGTTCAGACCGCCGTGACCTCCCATGATTGCGGAGCTCAAGTCCAGATGGAAAAAACCGATTGCAGTGTGAAGTTATAGAAAAGGATCAATGGGGACTCGGTCGAATTTCTATAAGAATCCCTCTTATGCGTACAACAAGAAATTAAACCTCAATTCCGTCCTTCAAAA...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131024871
ATGGGGACTCGGTCGAATTTCTATAAGAATCCCTCTTATGCGTACAACAAGAAATTAAACCTCAATTCCGTCCTTCAAAATCTCAATTCTTACAATATTGTCACCGGAAATGCTCCTGCGGAAGAACCAGCCGCCACAGTGAAAAGAAAGCGACGCCGTGAGTCGAGGCCGCCGCCTGATCAGCCGGATGAAGTTAAAGACTATGATTGTCCCATGTCCCACCAGGAGTATATTGAAAAACGCAGGAAGGAAGCTAATGT...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057810406.1
MGTRSNFYKNPSYAYNKKLNLNSVLQNLNSYNIVTGNAPAEEPAATVKRKRRRESRPPPDQPDEVKDYDCPMSHQEYIEKRRKEANVSQPYQELTADVLESSNSALKLVGYESDESTSADCEEDQGTSLVSEELSNPSRKLQYFPVSASTEEVDHIKTRNEQRYPAPGEPVCIICGNYGEYICNETDDDICSMECKAELLQRIKFQKEPQSEQLQVAPLSARRCTLEVPESGGDTWDYDRHRWSKKISGLCTYECWKCKK...

XP_057810412.1
MGTRSNFYKNPSYAYNKKLNLNSVLQNLNSYNIVTGNAPAEEPAATVKRKRRRESRPPPDQPDEVKDYDCPMSHQEYIEKRRKEANVSQPYQELTADVLESSNSALKLVGYESDESTSADCEEDQGTSLVSEELSNPSRKLQYFPVSASTEEVDHIKTRNEQRYPAPGEPVCIICGNYGEYICNETDDDICSMECKAELLQRIKFQKEPQSEQLQVAPLSARRCTLEVPESGGDTWDYDRHRWSKKISGLCTYECWKCKK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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