当前解析结果
SmilChr01G002385| 统一新 Gene ID | SmilChr01G002385 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G002385 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G002385 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 41085709 - 41094762 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131024978 |
|---|---|
| GeneID | 131024978 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131024978 |
| 原始查询 | SmilChr01G002385 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | root meristem growth factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827350]; symbol=RGF6; hit=AT4G16515; species=arabidopsis; confidence=weak |
| 产物 | root meristem growth factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827350]; symbol=RGF6; hit=AT4G16515; species=arabidopsis; confidence=weak |
| Arabidopsis | AT4G16515 (RGF6)root meristem growth factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827350] identity=80; qcov=0.156; evalue=7.56e-07; confidence=weak |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131024978 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Secreted | 分泌到胞外 | 1.00000 | XP_057810557.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057810557.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057810557.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057810557.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057810557.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:41094460 |
GA |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 13 | A14,B123,B136,B62,B95,C14,C15,C21,C29,C61,C73,C81,C9 |
Chr1:41094465 |
GAA |
G |
2bp_deletion | frameshift_variant | 13 | A14,B123,B136,B62,B95,C14,C15,C21,C29,C61,C73,C81,C9 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。