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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002399`

染色体: Chr01 坐标: 41331618-41337151 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002399`
名称	SmilChr01G002399
描述	14 kDa proline-rich protein DC2.15-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	41331618 - 41337151 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025074`
GeneID	`131025074`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025074`
原始查询	`SmilChr01G002399`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	14 kDa proline-rich protein DC2.15-like
产物	14 kDa proline-rich protein DC2.15-like
Arabidopsis	`AT4G12520` (AT4G12520) Bifunctional inhibitor/lipid-transfer protein/seed storage 2S albumin superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826864] identity=62; qcov=1; evalue=4.05e-48; confidence=medium
Rice	`Os04g0554600` (OsHyPRP07) - identity=58.8; qcov=0.956; evalue=3.54e-40; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00234 (Tryp_alpha_amyl); PF14547 (Hydrophob_seed)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025074

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	1.00000	`XP_057810661.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.40000	`XP_057810661.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057810661.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810661.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810661.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:41331752`	`CGT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B132,B41
`Chr1:41331752`	`CGT`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B132,B41
`Chr1:41331773`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A9,B126,B61
`Chr1:41331859`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,A21,A24,B122,B60
`Chr1:41331898`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B115
`Chr1:41331898`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B115
`Chr1:41331901`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B115
`Chr1:41336948`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B121,B128,B13,B37,C83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810661.1

137 aa

137

Tryp_alpha_amyl

Hydrophob_seed

PF00234 Tryp_alpha_amyl 53-136 aa PF14547 Hydrophob_seed 53-137 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810661.1`	Pfam	`PF00234`	Tryp_alpha_amyl	Domain	53	136	1.5e-15	57.9	Protease inhibitor/seed storage/LTP family
`XP_057810661.1`	Pfam	`PF14547`	Hydrophob_seed	Domain	53	137	6.5e-25	88.0	Hydrophobic seed protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954678.1
ACCATCCCACAAAAACCTAATTTCCTAAAGAGATCTTTAGGGGTTAATTATTTTCCCAGAAATGGCTTCCAAGCAAAAGACATCAATTGCACTATTCCTTGCCCTAAACATTCTCTTCTTCACCCTTTCGAGTGCGTGTGGAACGTGCCCCGGTCCGAACCCTAAGCCCAAACCTAAGCCAAAGCCGAAGCCAACTCCAAGCCCTAGCAAGGGTAGCTGCCCTAGAGATACCCTAAAACTAGGTGTGTGTGCTAAGTTGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025074
ATGGCTTCCAAGCAAAAGACATCAATTGCACTATTCCTTGCCCTAAACATTCTCTTCTTCACCCTTTCGAGTGCGTGTGGAACGTGCCCCGGTCCGAACCCTAAGCCCAAACCTAAGCCAAAGCCGAAGCCAACTCCAAGCCCTAGCAAGGGTAGCTGCCCTAGAGATACCCTAAAACTAGGTGTGTGTGCTAAGTTGCTCGATGGATTACTTGGTGTGACCGTGGGTACTCCTCCAAAGCAGCCATGCTGCAGCCTCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810661.1
MASKQKTSIALFLALNILFFTLSSACGTCPGPNPKPKPKPKPKPTPSPSKGSCPRDTLKLGVCAKLLDGLLGVTVGTPPKQPCCSLIEGLADLEAAVCLCTAIKANVLGINLNNVPVSLSLLLNVCSKKVPKGFVCA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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