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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002402`

染色体: Chr01 坐标: 41381329-41382443 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002402`
名称	SmilChr01G002402
描述	36.4 kDa proline-rich protein
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	41381329 - 41382443 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025101`
GeneID	`131025101`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025101`
原始查询	`SmilChr01G002402`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	36.4 kDa proline-rich protein
产物	36.4 kDa proline-rich protein
Arabidopsis	`AT1G62500` (AT1G62500) Bifunctional inhibitor/lipid-transfer protein/seed storage 2S albumin superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842547] identity=84.9; qcov=0.326; evalue=6.28e-45; confidence=low
Rice	`Os06g0643500` - identity=75.6; qcov=0.311; evalue=9.14e-32; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00234 (Tryp_alpha_amyl); PF14368 (LTP_2); PF14547 (Hydrophob_seed)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025101

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	0.60000	`XP_057810694.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057810694.1`
3	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057810694.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057810694.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810694.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:41381493`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B89,C15,C49,C73
`Chr1:41381493`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	4	B89,C15,C49,C73
`Chr1:41381532`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr1:41381560`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9
`Chr1:41381617`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,B53,C71
`Chr1:41381724`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B37,B99,C85
`Chr1:41381790`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A4,B110,B125,B90
`Chr1:41381826`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A4,B110,B125,B90
`Chr1:41382024`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr1:41382039`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B103,B86,C37,C87,C9
`Chr1:41382197`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B106,B27,B62,D3
`Chr1:41382213`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,B53,C71

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810694.1

264 aa

132

264

Hydrophob_seed

Tryp_alpha_amyl

LTP_2

PF14547 Hydrophob_seed 178-261 aa PF00234 Tryp_alpha_amyl 179-260 aa PF14368 LTP_2 179-260 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810694.1`	Pfam	`PF14547`	Hydrophob_seed	Domain	178	261	4e-24	85.5	Hydrophobic seed protein
`XP_057810694.1`	Pfam	`PF00234`	Tryp_alpha_amyl	Domain	179	260	3.5e-12	47.1	Protease inhibitor/seed storage/LTP family
`XP_057810694.1`	Pfam	`PF14368`	LTP_2	Family	179	260	9.7e-05	23.1	Probable lipid transfer

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954711.1
GCATATCATTCACGGGTTGCCCCAAAATTCAACTATAAAACCATGGATGAAAAAAAACCCTAAATCACAAACTCAAAAGATCCTGTCTTCCTTCCTCCCATGAACCCTAATTCGGCCATGGGTTCAAAGACTCTAGCAATGTTGTATATGTGCATGTTTTGCATGTTGATCACATTGCCACCAGCTTACTCTTGGCAACAAAACTGCCCACCACCCTACCCGCCCTACGGCGGCCGCCCCTCCCCGCCGTCAACCCCCGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025101
ATGAACCCTAATTCGGCCATGGGTTCAAAGACTCTAGCAATGTTGTATATGTGCATGTTTTGCATGTTGATCACATTGCCACCAGCTTACTCTTGGCAACAAAACTGCCCACCACCCTACCCGCCCTACGGCGGCCGCCCCTCCCCGCCGTCAACCCCCGGCCACCACCATCCTCACCCGCCGTCGCCTCCCAAACACCGCCCAAGCCCACACCCACACCCACACCCGCATCCACCGCCCTCGCCTCCCAAGCACCGCCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810694.1
MNPNSAMGSKTLAMLYMCMFCMLITLPPAYSWQQNCPPPYPPYGGRPSPPSTPGHHHPHPPSPPKHRPSPHPHPHPHPPPSPPKHRPPTRPHPSPPHPPVVVPPIIMPPPVISPPIIMPPPVISPPIIMPPPVINPPGIIPPIINPPVTRPPPSSSYPPYTPPGGKPGGGGTPPPPATCPIDALKLGLCLDVLGGLVHVGIGNPVENICCPVLQGLLELEAAVCLCTTIRLKLLNLNIFLPLALQLLATCGLTPPKGFVC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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