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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002431`

染色体: Chr01 坐标: 41845480-41847318 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002431`
名称	SmilChr01G002431
描述	probable xyloglucan galactosyltransferase GT19
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	41845480 - 41847318 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025334`
GeneID	`131025334`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025334`
原始查询	`SmilChr01G002431`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable xyloglucan galactosyltransferase GT19
产物	probable xyloglucan galactosyltransferase GT19
Arabidopsis	`AT4G22580` (AT4G22580) Exostosin family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828354] identity=70.8; qcov=0.932; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os10g0553600` (OSJNBa0015J15.1) - identity=54.8; qcov=0.941; evalue=6.55e-140; confidence=high
GO	GO:0006486 (GO:0006486); GO:0016757 (glycosyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF03016 (Exostosin_GT47)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025334

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057811048.1`
2	Golgi stack	高尔基堆	0.20000	`XP_057811048.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057811048.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811048.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811048.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:41845820`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B131,B78
`Chr1:41845927`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B6
`Chr1:41845990`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B101,B7,B87,C35
`Chr1:41845992`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C81
`Chr1:41845992`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C81
`Chr1:41845995`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C81
`Chr1:41846065`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C55
`Chr1:41846151`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B129,B57
`Chr1:41846476`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B29,C55,D11
`Chr1:41846491`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,B78
`Chr1:41846514`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr1:41846755`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811048.1

444 aa

222

444

Exostosin_GT47

PF03016 Exostosin_GT47 34-370 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811048.1`	Pfam	`PF03016`	Exostosin_GT47	Domain	34	370	2.4e-62	211.7	Exostosin GT47 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955065.1
GTGAAAGCTGTAATTCCACTATGATACAGTTAGTTATTCAATGCTACTGTGTTCCATATAATAATATTCTCTCCTAATAATTGAATCACTTTCTCCAAATTTATGGGCTTATCATAAACAAAGCTTAAAGCAACTCAAATTCAACACATCATTACATCAAAAAGAACAATAAATGTAACAAAAAAACATCAACCTAGAAACTAATTTTAATCACCAATGTAATAAAATGTAGTAGAAAAAATAACCGTCACAACTCCAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025334
ATGCCTCCACCACTCACCCCCACTCTCCTCCTCCTCCTCGTCGCCGCCGCCGCCGCCTCCGCCGCGGCGCAGGACTCCGATCTCGATCCCGACTGCACGGACCGATGGATCCACATCCGGCAACTCCCGCCACAATTCAATCTGGATCTCCTCTCGAACTGCTCGGAATACCCGGTGTTTGACGACTTCTGCCCCTACGCCGGCAACCACGGCCTCGGGCAGAAAACCCACAACTCCTCCCGCAGCTGGTACCGCACCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811048.1
MPPPLTPTLLLLLVAAAAASAAAQDSDLDPDCTDRWIHIRQLPPQFNLDLLSNCSEYPVFDDFCPYAGNHGLGQKTHNSSRSWYRTDPLMLELIFHRRMLEYPCLTADPALAAAVYLPYYAALDALRYLYGPDQNSSFLHGLDLFHFLTRLDRPSIWHRRGGHDHFLVMARPAWDFSQPLSNDPPIFGTSFLETPEFFNVTALTLEARAYPWQEQAVPYPTSFHPQNLGFLESWTQRVRRTRRSSLMLFAGGGGISANPN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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