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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002436`

染色体: Chr01 坐标: 41952225-41956509 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002436`
名称	SmilChr01G002436
描述	monocopper oxidase-like protein SKU5
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	41952225 - 41956509 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025400`
GeneID	`131025400`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025400`
原始查询	`SmilChr01G002436`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	monocopper oxidase-like protein SKU5
产物	monocopper oxidase-like protein SKU5
Arabidopsis	`AT4G12420` (SKU5) Cupredoxin superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826851] identity=82.1; qcov=0.959; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0104300` - identity=73.7; qcov=0.918; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005507 (copper ion binding); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0016491 (oxidoreductase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00394 (Cu-oxidase); PF07731 (Cu-oxidase_2); PF07732 (Cu-oxidase_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025400

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.80000	`XP_057811126.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057811126.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057811126.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811126.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811126.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:41952863`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr1:41953621`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51
`Chr1:41953900`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B113,B25
`Chr1:41954797`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C67
`Chr1:41954931`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr1:41955092`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr1:41955111`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,D4
`Chr1:41955324`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr1:41955400`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B112
`Chr1:41955583`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B18,C10
`Chr1:41955583`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B18,C10
`Chr1:41955879`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811126.1

587 aa

294

587

Cu-oxidase_3

Cu-oxidase

Cu-oxidase_2

PF07732 Cu-oxidase_3 34-147 aa PF00394 Cu-oxidase 160-313 aa PF07731 Cu-oxidase_2 399-534 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811126.1`	Pfam	`PF07732`	Cu-oxidase_3	Domain	34	147	4.6e-44	150.0	Multicopper oxidase
`XP_057811126.1`	Pfam	`PF00394`	Cu-oxidase	Domain	160	313	1.5e-46	159.1	Multicopper oxidase
`XP_057811126.1`	Pfam	`PF07731`	Cu-oxidase_2	Domain	399	534	2.7e-29	102.4	Multicopper oxidase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955143.1
TAAAAGGAAAATACGCGTGGAATCCAGTGTATTTTTATGTTCCATATGAACTGGCTATTGGCTGTCACACACGCACATGCACACGCCTCGTATACTAACTACTTCTCAACTCTCTCTGTATTTCTTTTTTTGTAATTGTTTGTTTCTTTTAGGGTGCTAAGTTTGAACGCTGTCTTTTTTCCATGCTTGTTTGCCAGTGGGGACCGACACCCATTTCTTCACCACACCTCACCTCACCTCACCTCCCCCAACACCCAACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025400
ATGGCTGGTTACTGCATTTTCTCTCTTTTGGTTATCAATATTTGCTTGCTGCTGGGTTCGTCTTTTGCTGATGATCCCTATGGTAACTATGAGTTCGTGGTTTCGTACATTACTGCTTCTCCACTTGGGGTCCCCCAGCAGGTAATTGCTGTAAATGGGAAATTTCCAGGTCCCACTATCAATGTAACAACCAACTACAATGTTGTTATCAATGTGAGAAACAAACTAGATGAGACCCTCTTAATCCACTGGTCTGGGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811126.1
MAGYCIFSLLVINICLLLGSSFADDPYGNYEFVVSYITASPLGVPQQVIAVNGKFPGPTINVTTNYNVVINVRNKLDETLLIHWSGIQQRRSSWQDGLLGTNCPIPPKWNWTYQFQVKDQVGSFFYFPSLNFQRASGGFGSIIVNNRAIIPIPFDTPHGDITIVIGDWYTQNHTALRKSLNGGKDLGMPDGVLINGKGPYRYNDTLVPDGIDHETLTVQPGKTYRIRVSNVGISTSLNFRIQNHNLLLAESEGSYTVQQN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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