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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002440`

染色体: Chr01 坐标: 41968603-41970256 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002440`
名称	SmilChr01G002440
描述	T-complex protein 1 subunit beta-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	41968603 - 41970256 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008248`
GeneID	`131008248`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008248`
原始查询	`SmilChr01G002440`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	T-complex protein 1 subunit beta-like
产物	T-complex protein 1 subunit beta-like
Arabidopsis	`AT5G20890` (AT5G20890) TCP-1/cpn60 chaperonin family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832213] identity=71; qcov=0.906; evalue=7.05e-60; confidence=high
Rice	`Os05g0556700` - identity=68.9; qcov=0.944; evalue=1.96e-61; confidence=high
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0005832 (chaperonin-containing T-complex); GO:0006457 (protein folding); GO:0051082 (GO:0051082); GO:0140662 (ATP-dependent protein folding chaperone)
KEGG	-
Pfam	PF00118 (Cpn60_TCP1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008248

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057791124.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057791124.1`
3	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057791124.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057791124.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791124.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:41968626`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	24	A1,A22,A5,A7,B105,B22,B29,B50,B66,B67,B75,B79,B8,B96,B98,C13,C2,C29,C42,C43,C48,C56,C60,C61
`Chr1:41968669`	`AAT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	9	A13,B124,B30,B70,B83,C28,C50,C58,C65
`Chr1:41968678`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	A13,B124
`Chr1:41968678`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	2	A13,B124
`Chr1:41968679`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B30,C65
`Chr1:41969192`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B103,C37,C56,C9
`Chr1:41969192`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B103,C37,C56,C9
`Chr1:41969197`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B103,C37,C56,C9
`Chr1:41969590`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,B119,C33

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791124.1

160 aa

160

Cpn60_TCP1

PF00118 Cpn60_TCP1 3-138 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791124.1`	Pfam	`PF00118`	Cpn60_TCP1	Family	3	138	1.6e-22	80.6	TCP-1/cpn60 chaperonin family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935141.1
ATGGAACTATTTGCCGTTGCTGGTGTGCTTGATATAGAGCATGCTGATTTTGATGGTATTGAGCGGCTAGGTCTTGTTACTGGTGGTGAACTAGCATCAACATCTGACAATCTTGAGTCTGTTAAGCTTGGGCACTGCAAACTCATTGAAGAAATTATGATTGGCGAGGACAGGTTGATACACTTCGCTGGGGTTGCTGCAGGCATGTACGATTGTGCTGAGAGATGCAAGGTCTTTGCTGTCTTTTGGCTTGAAAATCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008248
ATGGAACTATTTGCCGTTGCTGGTGTGCTTGATATAGAGCATGCTGATTTTGATGGTATTGAGCGGCTAGGTCTTGTTACTGGTGGTGAACTAGCATCAACATCTGACAATCTTGAGTCTGTTAAGCTTGGGCACTGCAAACTCATTGAAGAAATTATGATTGGCGAGGACAGGTTGATACACTTCGCTGGGGTTGCTGCAGGCATGTACGATTGTGCTGAGAGATGCAAGGTCTTTGCTGTCTTTTGGCTTGAAAATCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791124.1
MELFAVAGVLDIEHADFDGIERLGLVTGGELASTSDNLESVKLGHCKLIEEIMIGEDRLIHFAGVAAGMYDCAERCKVFAVFWLENPHMLDEPERSLHDALCVLTQTANDSRVLLGGGWPEMVMTKAVDELAMKTPGKIEAFKLQSKAGHGGGKIICEEA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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