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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002455`

染色体: Chr01 坐标: 42152156-42156065 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002455`
名称	SmilChr01G002455
描述	uncharacterized SmilChr01G002455
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	42152156 - 42156065 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025595`
GeneID	`131025595`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025595`
原始查询	`SmilChr01G002455`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	dimethylallyl, adenosine tRNA methylthiotransferase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842577]; symbol=AT1G62780; hit=AT1G62780; species=arabidopsis; confidence=high
产物	dimethylallyl, adenosine tRNA methylthiotransferase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842577]; symbol=AT1G62780; hit=AT1G62780; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G62780` (AT1G62780) dimethylallyl, adenosine tRNA methylthiotransferase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842577] identity=63.5; qcov=1; evalue=1.2e-108; confidence=high
Rice	`Os04g0105700` - identity=62.3; qcov=0.924; evalue=5.67e-78; confidence=high
GO	GO:0009570 (chloroplast stroma)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025595

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057811379.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057811379.1`
3	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.20000	`XP_057811379.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057811384.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811384.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:42153053`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B1,B7,C35
`Chr1:42153053`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B1,B7,C35
`Chr1:42153070`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B27,B35,B76,D10
`Chr1:42153481`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B100,B107,C5
`Chr1:42154527`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,B10,B113,B25
`Chr1:42154578`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:42154591`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B103,C37,C56,C9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955401.1
AATGGAATTTAATTGAAATATTAACCTTTTACAATAACTTCTTCTTCTTTCTTTTTTTTTTTCATGAAATCAGTATGTTTAAGAAGTTTAATTAGATTTGAATAATCAGACATATTAATTCACTTATTTTATCATATACAGTTTAATGATACTCAGCTCCACTTAATTACCTTATTCCCCATGGCTATGGATAGCGTTAGCCATATCCATAAATCCTCTCAAGAAATTCAATATGAAGTTTCCTGACACGGTTTTGAGCA...

XM_057955396.1
TACTCAGCTCCACTTAATTACCTTATTCCCCATGGCTATGGATAGCGTTAGCCATATCCATAAATCCTCTCAAGAAATTCAATATGAAGTTTCCTGACACGGTTTTGAGCAAAATCCAAACAGATAACCAACAAGCTTCTGCTCAAACAAAGGCCGCTCATGGCCTCTTCTCTTCGCTTCAGCTGCGCAGTTCCTATCTCAATCTCCAGATCGACAAAACCCAGAAATCAACCAGCTAAAATTCGCTGCATAGGATGGGA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131025595
ATGGCCTCTTCTCTTCGCTTCAGCTGCGCAGTTCCTATCTCAATCTCCAGATCGACAAAACCCAGAAATCAACCAGCTAAAATTCGCTGCATAGGATGGGACCCGGAAGGCGTGCTCGGAGCTCCGAAGCCAGGACACATAGCGAGGCTGGAATTCAAGCGACGTCTCGATAAGGATTCCGAGGCCCGAGAAGCATTTGAACGCCAAGTCCGAGAAGAGAAAGACCGCACGCGAAGACTTCGCGAGTCTCGGGTGATACC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057811379.1
MASSLRFSCAVPISISRSTKPRNQPAKIRCIGWDPEGVLGAPKPGHIARLEFKRRLDKDSEAREAFERQVREEKDRTRRLRESRVIPDTVEELVEYFLDTEAQEIEFEISRLRPRLNEEFFSHLKLELGKLKFSVSKTQDVEDRVIELETLQKALEEATEAYDKMQAELVTARESLKRILQSSDVKATLLDLVGENSLNRSLLTLLDQNIASAYQGNQVREFIYEMLLALFCLDGGSFLVLRFGFRDLKSIKVL

XP_057811384.1
MASSLRFSCAVPISISRSTKPRNQPAKIRCIGWDPEGVLGAPKPGHIARLEFKRRLDKDSEAREAFERQVREEKDRTRRLRESRVIPDTVEELVEYFLDTEAQEIEFEISRLRPRLNEEFFSHLKLELGKLKFSVSKTQDVEDRVIELETLQKALEEATEAYDKMQAELVTARESLKRILQSSDVKATLLDLVGENSLNRSLLTLLDQNIASAYQGNQKQAAEYMEKIRGAMLKYITV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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