当前解析结果
SmilChr01G002460| 统一新 Gene ID | SmilChr01G002460 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G002460 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G002460 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 42241319 - 42251054 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131025626 |
|---|---|
| GeneID | 131025626 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131025626 |
| 原始查询 | SmilChr01G002460 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | copper ion binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826843]; symbol=AT4G12340; hit=AT4G12340; species=arabidopsis; confidence=medium |
| 产物 | copper ion binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826843]; symbol=AT4G12340; hit=AT4G12340; species=arabidopsis; confidence=medium |
| Arabidopsis | AT4G12340 (AT4G12340)copper ion binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826843] identity=47.3; qcov=0.96; evalue=6.33e-41; confidence=medium |
| Rice | Os05g0103500- identity=44.2; qcov=1; evalue=1.26e-34; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131025626 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Mitochondrion | 线粒体 | 1.00000 | XP_057811407.1 |
| 2 | Mitochondrion intermembrane space | Mitochondrion intermembrane space | 1.00000 | XP_057811407.1 |
| 3 | Mitochondrion membrane | 线粒体膜 | 1.00000 | XP_057811407.1 |
| 4 | Mitochondrion inner membrane | 线粒体内膜 | 0.40000 | XP_057811407.1 |
| 5 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057811407.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:42250221 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D4 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
5 records
下载 cDNA FASTA5 records
下载 CDS FASTA5 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。